More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0934 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0934  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 388 aa  764    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1325  amino acid permease-associated region  62.95 
 
 		 464 aa  378  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1487  amino acid transporter  31.03 
 
 		 452 aa  187  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.838437  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2591  amino acid permease-associated region  30.15 
 
 		 454 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196035 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0763  amino acid permease-associated region  31.06 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45240  putative amino acid permease  30.61 
 
 		 455 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2010  amino acid permease-associated region  30.18 
 
 		 468 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1685  amino acid transporter  26.58 
 
 		 468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179988  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1651  amino acid permease  28.09 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2325  amino acid permease  27.58 
 
 		 469 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1020  amino acid permease  27.32 
 
 		 470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4210  amino acid permease-associated region  27.01 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3736  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 468 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1106  amino acid permease  27.58 
 
 		 469 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0877  amino acid permease  27.58 
 
 		 469 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0591  amino acid permease  27.58 
 
 		 469 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1844  amino acid permease  27.58 
 
 		 469 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742156  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3841  putative amino acid permease  31.06 
 
 		 455 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4321  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4045  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4289  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3200  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 468 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  28.45 
 
 		 440 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 463 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  23.82 
 
 		 471 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  23.82 
 
 		 471 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  23.82 
 
 		 471 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 466 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 454 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 457 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 457 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 457 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 486 aa  90.5  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  27.07 
 
 		 443 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  22.58 
 
 		 471 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 		 494 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  22.58 
 
 		 471 aa  86.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  22.58 
 
 		 471 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 491 aa  86.3  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  22.58 
 
 		 471 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  22.83 
 
 		 471 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  22.83 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  26.11 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  24.64 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 436 aa  82.8  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  25 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  22.64 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  23.63 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  22.86 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  22.64 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  23.38 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  23.38 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  23.38 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  23.38 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  23.38 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  23.38 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  26.98 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  26.43 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  26.02 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  23.48 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  26.04 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  31.75 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 453 aa  76.3  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  23.27 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  25.19 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  25.19 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  25.19 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  23.89 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  25.19 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  23.43 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  24.45 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  25.43 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  25.19 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  27.33 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  22.39 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>