More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5065 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 457 aa  899    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  60 
 
 		 441 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  41.88 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  26.32 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  26.56 
 
 		 485 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 499 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  26.56 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  24.48 
 
 		 489 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 448 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  24.48 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  27.32 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 482 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  25.34 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  25.34 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  25.34 
 
 		 437 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  25.07 
 
 		 437 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  24.9 
 
 		 490 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  25.34 
 
 		 438 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  25.34 
 
 		 438 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  25.34 
 
 		 438 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 		 443 aa  99.8  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  25.07 
 
 		 438 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  26.25 
 
 		 462 aa  99  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  26.25 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  26.03 
 
 		 462 aa  98.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  26.25 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  26.25 
 
 		 462 aa  99  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  26.11 
 
 		 445 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 461 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  22.3 
 
 		 439 aa  97.1  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  25.88 
 
 		 445 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  24.29 
 
 		 431 aa  96.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  24.29 
 
 		 431 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 437 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  24.07 
 
 		 426 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 495 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  25.78 
 
 		 445 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  26 
 
 		 474 aa  93.2  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 467 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 		 436 aa  91.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 454 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 440 aa  90.9  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 440 aa  90.9  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 484 aa  90.5  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  26.74 
 
 		 473 aa  89.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 486 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 495 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  24.72 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  26.19 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  22.89 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  24.73 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  26.36 
 
 		 580 aa  84.7  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  24.31 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  24.31 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  22.12 
 
 		 506 aa  84  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  24.16 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  25.25 
 
 		 528 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  23.43 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 770 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 		 503 aa  82.4  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 		 532 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 543 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  23.42 
 
 		 488 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2591  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196035 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 740 aa  81.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  26.39 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  26.39 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  25.9 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 537 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  26.39 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  24.75 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  25.87 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  22.06 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 494 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  23.73 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  23.73 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  22.74 
 
 		 501 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  26.12 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  26.12 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1685  amino acid transporter  25.28 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179988  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  26.12 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  26.12 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01631  methionine transporter (Eurofung)  24.27 
 
 		 540 aa  77  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.281549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 530 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>