More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4517 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 502 aa  1000    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  30.87 
 
 		 510 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  30.13 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  32.65 
 
 		 496 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  29.53 
 
 		 521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  29.67 
 
 		 521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  29.67 
 
 		 521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  32.16 
 
 		 527 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 		 494 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 505 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  28.91 
 
 		 506 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  32.2 
 
 		 492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  31.72 
 
 		 499 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  31.49 
 
 		 539 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  31.49 
 
 		 499 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  31.04 
 
 		 503 aa  160  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 538 aa  157  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  28.79 
 
 		 513 aa  153  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  29.59 
 
 		 562 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  29.65 
 
 		 531 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  27.94 
 
 		 547 aa  136  9e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  28.89 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  29.8 
 
 		 496 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  26.07 
 
 		 519 aa  133  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  30.52 
 
 		 549 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  25.44 
 
 		 521 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 514 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 505 aa  123  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 		 483 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 		 483 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  26.26 
 
 		 510 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  29.25 
 
 		 487 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 530 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 486 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 486 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 486 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  27.09 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 497 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 		 514 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 522 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.62 
 
 		 532 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 504 aa  104  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 543 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  25.51 
 
 		 514 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  24.11 
 
 		 538 aa  100  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 483 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 483 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.59 
 
 		 507 aa  94.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 455 aa  93.2  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 520 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  24.27 
 
 		 523 aa  89.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  22.2 
 
 		 515 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  22.65 
 
 		 530 aa  89  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  25.64 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  24.84 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  24.84 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  24.84 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  24.84 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  24.84 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.05 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  25.05 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  24.84 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  25.07 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  29.39 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.69 
 
 		 499 aa  81.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.78 
 
 		 532 aa  81.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  22.91 
 
 		 544 aa  80.1  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 500 aa  79.7  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  25.37 
 
 		 539 aa  79.3  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  24.24 
 
 		 576 aa  79  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.32 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  25.59 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  27.27 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 477 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 437 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 		 452 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 475 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  20.19 
 
 		 518 aa  75.5  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 506 aa  75.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  24.32 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 501 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 518 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  29.88 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  29.88 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.1 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.1 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.1 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 		 486 aa  73.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>