More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0940 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 504 aa  1007    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  43.5 
 
 		 496 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  31.61 
 
 		 505 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  33.19 
 
 		 494 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  31.51 
 
 		 486 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  31.51 
 
 		 486 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  31.51 
 
 		 486 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  31.48 
 
 		 506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  30.18 
 
 		 505 aa  213  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  33.8 
 
 		 487 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 483 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 483 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  30.24 
 
 		 497 aa  196  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  34 
 
 		 483 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  30.51 
 
 		 483 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 547 aa  143  6e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 521 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  24.8 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  26.95 
 
 		 513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  29.71 
 
 		 531 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 		 549 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  26.27 
 
 		 519 aa  110  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 562 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 502 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  25.46 
 
 		 521 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 450 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 528 aa  91.3  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 496 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  27.25 
 
 		 519 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  25.63 
 
 		 527 aa  88.6  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 		 450 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  25.54 
 
 		 450 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  25.07 
 
 		 456 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 450 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 499 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 539 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 492 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  25.53 
 
 		 510 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  25.76 
 
 		 530 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  24.17 
 
 		 456 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 510 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  26.91 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  26.63 
 
 		 440 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  24.71 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 530 aa  77.4  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  23.69 
 
 		 514 aa  77.8  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  23.34 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  28.07 
 
 		 506 aa  76.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  25.07 
 
 		 443 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 514 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  24.74 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  29.05 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  23.22 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  23.22 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  23.22 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  23.22 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  23.22 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  26.07 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1448  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 511 aa  73.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0115525  hitchhiker  0.00101809 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  23.22 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  23.22 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  27.14 
 
 		 580 aa  73.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  23.12 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2141  amino acid transporter  26.5 
 
 		 510 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.109603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  25.79 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  24.17 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3839  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.301841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3322  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 511 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.427023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 526 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  30.6 
 
 		 490 aa  70.5  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  24 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  27.54 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  28.61 
 
 		 433 aa  70.1  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  25.54 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  24.94 
 
 		 539 aa  69.3  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 511 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>