More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1448 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  70.78 
 
 		 503 aa  724    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  77.45 
 
 		 514 aa  789    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  74.84 
 
 		 489 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2418  lysine transporter  73.98 
 
 		 490 aa  732    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  78.84 
 
 		 520 aa  783    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3583  amino acid permease-associated region  64.71 
 
 		 520 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  74.64 
 
 		 489 aa  740    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126674 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  74.64 
 
 		 489 aa  740    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  74.64 
 
 		 489 aa  740    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1929  lysine transporter  74.13 
 
 		 491 aa  723    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.148093  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1448  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 511 aa  1016    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0115525  hitchhiker  0.00101809 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3945  amino acid permease-associated region  64.71 
 
 		 520 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  79.05 
 
 		 538 aa  780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3839  amino acid permease-associated region  66.73 
 
 		 513 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.301841 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1757  lysine-specific permease transmembrane protein  70.26 
 
 		 509 aa  657    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  90.85 
 
 		 512 aa  896    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  74.64 
 
 		 489 aa  740    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4637  amino acid permease-associated region  68.58 
 
 		 509 aa  662    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.731379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4318  amino acid permease-associated region  70.37 
 
 		 493 aa  689    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.193493  normal  0.498738 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  76.78 
 
 		 526 aa  765    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  76.44 
 
 		 511 aa  781    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  74.84 
 
 		 489 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  63.52 
 
 		 488 aa  635    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  64.36 
 
 		 490 aa  634    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  74.64 
 
 		 489 aa  740    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  74.43 
 
 		 489 aa  738    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2323  lysine transporter  73.36 
 
 		 492 aa  726    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  78.63 
 
 		 511 aa  776    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  74.07 
 
 		 493 aa  746    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  70.78 
 
 		 503 aa  724    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  76.83 
 
 		 526 aa  751    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1658  lysine transporter  73.72 
 
 		 491 aa  716    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  78.84 
 
 		 520 aa  783    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  78.84 
 
 		 520 aa  783    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1490  amino acid permease-associated region  69.35 
 
 		 507 aa  652    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819363  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  74.84 
 
 		 489 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1404  amino acid permease-associated region  72.34 
 
 		 506 aa  710    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  71.22 
 
 		 487 aa  706    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  76.83 
 
 		 526 aa  751    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  78.84 
 
 		 520 aa  783    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  74.64 
 
 		 489 aa  740    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1449  amino acid permease-associated region  69.35 
 
 		 507 aa  651    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0168502  hitchhiker  0.00111111 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  74.64 
 
 		 489 aa  740    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  73.14 
 
 		 526 aa  746    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  78.84 
 
 		 520 aa  783    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2141  amino acid transporter  66.8 
 
 		 510 aa  658    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.109603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2396  amino acid transporter  77.11 
 
 		 511 aa  782    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  74.84 
 
 		 489 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1489  amino acid permease-associated region  97.85 
 
 		 511 aa  1000    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00379868  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  74.64 
 
 		 489 aa  740    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  78.63 
 
 		 520 aa  778    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  70.78 
 
 		 503 aa  724    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  74.43 
 
 		 489 aa  738    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1856  amino acid permease-associated region  71.52 
 
 		 493 aa  692    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.368764 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4928  lysine-specific permease  80 
 
 		 510 aa  773    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.382341  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0393  lysine-specific permease  65.34 
 
 		 492 aa  648    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.449766  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  76.83 
 
 		 526 aa  751    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  78.84 
 
 		 520 aa  783    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4422  amino acid permease-associated region  64.71 
 
 		 520 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  79.05 
 
 		 538 aa  780    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  74.84 
 
 		 489 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3322  amino acid permease-associated region  67.01 
 
 		 511 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.427023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  74.13 
 
 		 526 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  78.63 
 
 		 536 aa  777    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  71.01 
 
 		 487 aa  704    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  62.47 
 
 		 488 aa  631  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  61.67 
 
 		 488 aa  627  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  61.67 
 
 		 488 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  61.88 
 
 		 488 aa  626  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  61.46 
 
 		 488 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  61.88 
 
 		 488 aa  626  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  61.84 
 
 		 488 aa  625  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  61.25 
 
 		 488 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  61.84 
 
 		 488 aa  625  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  61.04 
 
 		 488 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2247  amino acid permease-associated region  60.13 
 
 		 496 aa  592  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  59.18 
 
 		 500 aa  579  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  54.97 
 
 		 527 aa  545  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1500  amino acid permease-associated region  53.91 
 
 		 491 aa  542  1e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00425052  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  52.88 
 
 		 479 aa  538  1e-151  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1821  lysine-specific permease  55.29 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0954  lysine-specific permease  55.8 
 
 		 496 aa  531  1e-150  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  50 
 
 		 488 aa  508  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  50.82 
 
 		 489 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  50.61 
 
 		 489 aa  502  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1245  amino acid permease family protein  51.8 
 
 		 500 aa  497  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000163371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1739  amino acid permease-associated region  51.37 
 
 		 497 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000499031  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1773  amino acid permease-associated region  51.37 
 
 		 497 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00284908  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2751  amino acid permease-associated region  50.2 
 
 		 505 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0918  amino acid permease-associated region  49.6 
 
 		 500 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0412  amino acid transporter  48.84 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000422224  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1394  amino acid permease-associated region  43.72 
 
 		 484 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000062877  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1421  amino acid permease-associated region  43.72 
 
 		 484 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000107039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  43.25 
 
 		 471 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  43.41 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  43.01 
 
 		 472 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  43.63 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  41.28 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  41.67 
 
 		 473 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  41.7 
 
 		 473 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>