More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2141 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4637  amino acid permease-associated region  92.43 
 
 
509 aa  919    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.731379  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  65 
 
 
489 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  70.36 
 
 
511 aa  730    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  65 
 
 
489 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  63.75 
 
 
489 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  63.75 
 
 
489 aa  642    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  63.75 
 
 
489 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  62.25 
 
 
503 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  63.75 
 
 
489 aa  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  62.25 
 
 
503 aa  651    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  65.78 
 
 
512 aa  661    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  65 
 
 
489 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3583  amino acid permease-associated region  93.65 
 
 
520 aa  953    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542229  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2418  lysine transporter  65.15 
 
 
490 aa  654    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  69.63 
 
 
511 aa  726    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  70.67 
 
 
526 aa  746    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  71.26 
 
 
526 aa  734    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  63.75 
 
 
489 aa  642    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  70.45 
 
 
520 aa  713    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  62.25 
 
 
503 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1489  amino acid permease-associated region  65.59 
 
 
511 aa  661    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00379868  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3839  amino acid permease-associated region  96.85 
 
 
513 aa  969    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.301841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  66.18 
 
 
487 aa  661    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  63.75 
 
 
489 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  63.75 
 
 
489 aa  642    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  70.45 
 
 
520 aa  713    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  64.46 
 
 
493 aa  653    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  70.45 
 
 
520 aa  713    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2323  lysine transporter  65.15 
 
 
492 aa  649    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  70.45 
 
 
520 aa  713    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  63.54 
 
 
489 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  70.45 
 
 
520 aa  713    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  70.45 
 
 
520 aa  713    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3945  amino acid permease-associated region  93.65 
 
 
520 aa  953    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  70.08 
 
 
526 aa  729    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  70.14 
 
 
538 aa  733    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  71.93 
 
 
514 aa  729    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2141  amino acid transporter  100 
 
 
510 aa  1020    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.109603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2396  amino acid transporter  71.95 
 
 
511 aa  729    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953097  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  63.75 
 
 
489 aa  642    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  70.25 
 
 
520 aa  709    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1448  amino acid permease-associated region  66 
 
 
511 aa  662    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0115525  hitchhiker  0.00101809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4928  lysine-specific permease  65.38 
 
 
510 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.382341  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  71.26 
 
 
526 aa  734    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  72.47 
 
 
526 aa  736    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4422  amino acid permease-associated region  93.65 
 
 
520 aa  953    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  70.14 
 
 
538 aa  733    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  65 
 
 
489 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3322  amino acid permease-associated region  96.46 
 
 
511 aa  959    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.427023  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  70.02 
 
 
526 aa  731    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  69.63 
 
 
536 aa  727    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  63.75 
 
 
489 aa  642    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0126674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  66.46 
 
 
487 aa  658    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  65 
 
 
489 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1658  lysine transporter  62.03 
 
 
491 aa  624  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271465  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4318  amino acid permease-associated region  62.35 
 
 
493 aa  619  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.193493  normal  0.498738 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1929  lysine transporter  61.83 
 
 
491 aa  620  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.148093  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1404  amino acid permease-associated region  59.91 
 
 
506 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1856  amino acid permease-associated region  60.55 
 
 
493 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.368764 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0393  lysine-specific permease  59.79 
 
 
492 aa  591  1e-167  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.449766  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1449  amino acid permease-associated region  58.61 
 
 
507 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0168502  hitchhiker  0.00111111 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1757  lysine-specific permease transmembrane protein  59.44 
 
 
509 aa  568  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1490  amino acid permease-associated region  58.4 
 
 
507 aa  571  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819363  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  56.85 
 
 
490 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  54.21 
 
 
488 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2247  amino acid permease-associated region  57.66 
 
 
496 aa  555  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  54.23 
 
 
488 aa  550  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  54.23 
 
 
488 aa  548  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  54.02 
 
 
488 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  54.23 
 
 
488 aa  550  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  54.43 
 
 
488 aa  550  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  54.23 
 
 
488 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  54.23 
 
 
488 aa  550  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  53.81 
 
 
488 aa  547  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  53.4 
 
 
488 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  53.61 
 
 
488 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  53.66 
 
 
500 aa  522  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0954  lysine-specific permease  54.24 
 
 
496 aa  520  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  52.74 
 
 
479 aa  514  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  52.8 
 
 
527 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1500  amino acid permease-associated region  52.87 
 
 
491 aa  504  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00425052  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1821  lysine-specific permease  50.84 
 
 
489 aa  486  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  47.6 
 
 
489 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  47.19 
 
 
489 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  46.5 
 
 
488 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0412  amino acid transporter  48.41 
 
 
477 aa  458  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000422224  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1773  amino acid permease-associated region  49.69 
 
 
497 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00284908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1739  amino acid permease-associated region  49.69 
 
 
497 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000499031  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1245  amino acid permease family protein  47.52 
 
 
500 aa  437  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000163371  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0918  amino acid permease-associated region  46.06 
 
 
500 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2751  amino acid permease-associated region  45.27 
 
 
505 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1421  amino acid permease-associated region  40.29 
 
 
484 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000107039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1394  amino acid permease-associated region  40.29 
 
 
484 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000062877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0902  amino acid permease family protein  43.22 
 
 
482 aa  360  4e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0966568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  43.3 
 
 
468 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  41.29 
 
 
474 aa  353  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  41.95 
 
 
513 aa  353  5e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  43.3 
 
 
468 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  41.95 
 
 
474 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  41.74 
 
 
478 aa  351  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>