More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7845 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  71.69 
 
 		 539 aa  659    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  72.93 
 
 		 492 aa  658    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  71.69 
 
 		 499 aa  659    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  71.89 
 
 		 499 aa  662    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  72.36 
 
 		 496 aa  673    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  100 
 
 		 527 aa  1029    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  29.86 
 
 		 506 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  30.38 
 
 		 521 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  29.81 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  29.81 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  32.58 
 
 		 503 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  32.16 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  31.11 
 
 		 538 aa  182  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  29.47 
 
 		 521 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  32.17 
 
 		 513 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  30.46 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  32.06 
 
 		 531 aa  172  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 		 510 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  31.58 
 
 		 549 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 		 505 aa  159  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  32.37 
 
 		 519 aa  154  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  32.82 
 
 		 562 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  28.68 
 
 		 519 aa  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 494 aa  150  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 527 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  27.94 
 
 		 528 aa  143  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  25.76 
 
 		 518 aa  134  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 506 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 486 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 486 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 486 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.24 
 
 		 542 aa  123  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  28.53 
 
 		 516 aa  121  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 505 aa  120  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  25.76 
 
 		 510 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 		 497 aa  117  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  26.7 
 
 		 538 aa  116  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  27.86 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  27.86 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 510 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 		 487 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 515 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 543 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  24.08 
 
 		 570 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  25.46 
 
 		 570 aa  103  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 483 aa  103  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  23.72 
 
 		 571 aa  103  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 520 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  24.95 
 
 		 544 aa  101  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 522 aa  100  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  22.2 
 
 		 530 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  26.79 
 
 		 496 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  24.44 
 
 		 547 aa  97.8  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 483 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  25.26 
 
 		 523 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 504 aa  95.1  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  27.01 
 
 		 468 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  28.44 
 
 		 476 aa  91.7  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.61 
 
 		 527 aa  90.1  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.86 
 
 		 532 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.7 
 
 		 507 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  28.35 
 
 		 753 aa  87.4  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 454 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  24.39 
 
 		 455 aa  86.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  25.55 
 
 		 514 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  24.4 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  24.43 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  19.74 
 
 		 495 aa  80.9  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  22.72 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  21.4 
 
 		 537 aa  79  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  23.5 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  27.82 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  23.42 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  30.56 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  21.83 
 
 		 539 aa  76.6  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  24.25 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  24.22 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 520 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  24.25 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.1 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  23.31 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  26.81 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  23.56 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2714  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 		 521 aa  74.3  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101766  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  27.84 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  25.16 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>