More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0901 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 531 aa  1019    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  66.67 
 
 		 549 aa  539  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  56.05 
 
 		 503 aa  478  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  55.15 
 
 		 513 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  56.58 
 
 		 519 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  42.72 
 
 		 521 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  43.48 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  42.72 
 
 		 521 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  42.72 
 
 		 521 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  42 
 
 		 538 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  42.46 
 
 		 562 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 505 aa  203  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 494 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  30.72 
 
 		 547 aa  194  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 		 506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 497 aa  167  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  32.37 
 
 		 483 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  32.37 
 
 		 483 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 510 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 		 505 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  29.2 
 
 		 502 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  32.37 
 
 		 487 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  31.67 
 
 		 527 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  29.81 
 
 		 527 aa  154  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 486 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 486 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 486 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  29.5 
 
 		 519 aa  150  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 528 aa  148  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  30.04 
 
 		 496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  27.93 
 
 		 521 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  30.95 
 
 		 539 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  30.95 
 
 		 499 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  30.95 
 
 		 499 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  29.19 
 
 		 522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  29.76 
 
 		 504 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  30.16 
 
 		 496 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 		 514 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  32.53 
 
 		 483 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  29.96 
 
 		 483 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  31.85 
 
 		 514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  29.27 
 
 		 522 aa  120  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.48 
 
 		 532 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  26.92 
 
 		 523 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  26.94 
 
 		 510 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  29.5 
 
 		 516 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  27.1 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  25.19 
 
 		 570 aa  110  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  24.95 
 
 		 526 aa  105  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 543 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.57 
 
 		 527 aa  98.2  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 		 520 aa  96.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 440 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  25.19 
 
 		 530 aa  94  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 440 aa  90.9  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.37 
 
 		 507 aa  90.5  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 462 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 462 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 462 aa  90.1  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 454 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.95 
 
 		 532 aa  87.4  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  24.02 
 
 		 576 aa  86.3  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  27.06 
 
 		 539 aa  86.3  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  26.12 
 
 		 463 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  23.11 
 
 		 515 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.32 
 
 		 542 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  24.36 
 
 		 544 aa  83.6  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  24.63 
 
 		 518 aa  83.2  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.51 
 
 		 517 aa  82.4  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  21.93 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  31.19 
 
 		 538 aa  80.9  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  23.54 
 
 		 570 aa  80.1  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  25.84 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  47.57 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  25.43 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  24.88 
 
 		 496 aa  77  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  24.86 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  23.06 
 
 		 514 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  24.92 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  26.42 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 518 aa  74.3  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  23.61 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  25.38 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>