More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_49570 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  100 
 
 		 496 aa  965    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  43.5 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  33.47 
 
 		 505 aa  269  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  34.76 
 
 		 494 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  33.74 
 
 		 506 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  36.42 
 
 		 486 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  36.42 
 
 		 486 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  36.42 
 
 		 486 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  36.28 
 
 		 483 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  36.28 
 
 		 483 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  36.51 
 
 		 487 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  32.6 
 
 		 497 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  35.02 
 
 		 483 aa  216  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  33.76 
 
 		 505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  34.9 
 
 		 483 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  29.49 
 
 		 521 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  29.86 
 
 		 521 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  29.86 
 
 		 521 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  30.58 
 
 		 547 aa  189  8e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  29.2 
 
 		 506 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  30.92 
 
 		 503 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  27.71 
 
 		 538 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  28.54 
 
 		 513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  29.21 
 
 		 549 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 562 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 		 502 aa  139  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  27.31 
 
 		 519 aa  136  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  30.16 
 
 		 531 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  26.75 
 
 		 519 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  26.07 
 
 		 521 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 522 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  27.69 
 
 		 514 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 		 514 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 510 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 		 492 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 515 aa  96.7  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 543 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 496 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 		 520 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  26.02 
 
 		 527 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  25.62 
 
 		 570 aa  93.6  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 527 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  24.77 
 
 		 539 aa  92.4  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  25.2 
 
 		 544 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  28 
 
 		 523 aa  83.6  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  25.27 
 
 		 514 aa  83.2  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 539 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 499 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  26.44 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  25.65 
 
 		 570 aa  80.5  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 		 522 aa  80.1  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 530 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 		 510 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  25 
 
 		 530 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  24.09 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  21.89 
 
 		 571 aa  77.8  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 516 aa  77.4  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  25.7 
 
 		 547 aa  77.4  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  26.3 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  25.92 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  25 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.95 
 
 		 532 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 520 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  27.22 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  24.36 
 
 		 465 aa  74.3  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  25.98 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  25.19 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3130  amino acid permease-associated region  26.9 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  25.2 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  29.03 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  26.49 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  26.9 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  26.9 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  23.42 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  26.62 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  25.92 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>