More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3724 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  88.98 
 
 		 538 aa  865    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 562 aa  1116    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  58.67 
 
 		 521 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  58.01 
 
 		 521 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  58.01 
 
 		 521 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  58.35 
 
 		 506 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  47.49 
 
 		 513 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  46.34 
 
 		 503 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  44.49 
 
 		 519 aa  363  4e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  42.46 
 
 		 531 aa  360  4e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  41.34 
 
 		 549 aa  326  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  31.62 
 
 		 506 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  30.12 
 
 		 505 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  29.42 
 
 		 494 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  30.5 
 
 		 547 aa  189  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  28.72 
 
 		 505 aa  180  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  32.6 
 
 		 527 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  28.96 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  28.96 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  28.96 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  29.05 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 		 483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 		 483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 		 487 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  29.19 
 
 		 528 aa  162  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  29.07 
 
 		 496 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  30.26 
 
 		 483 aa  157  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 		 510 aa  156  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  30.84 
 
 		 496 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  30.8 
 
 		 499 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 		 527 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  25.98 
 
 		 519 aa  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  30.4 
 
 		 492 aa  151  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 		 497 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  31.4 
 
 		 539 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  30.58 
 
 		 499 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  30.5 
 
 		 483 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 		 522 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  27.73 
 
 		 521 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 515 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 510 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 530 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  27.62 
 
 		 510 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  27.49 
 
 		 523 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 514 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 		 504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  29.17 
 
 		 516 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 543 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 520 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  29.85 
 
 		 522 aa  120  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  23.62 
 
 		 530 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 443 aa  105  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  28.65 
 
 		 447 aa  104  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 		 443 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  27.82 
 
 		 443 aa  103  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  28.37 
 
 		 443 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  23.84 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 456 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 		 443 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 459 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  28.72 
 
 		 471 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  26.67 
 
 		 443 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  26.9 
 
 		 456 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  26.9 
 
 		 456 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 		 476 aa  96.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  29.12 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  29.12 
 
 		 440 aa  95.1  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 473 aa  94.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  29.16 
 
 		 476 aa  94.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 454 aa  94  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  26.03 
 
 		 434 aa  94  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 461 aa  94  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 465 aa  94  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  25.74 
 
 		 461 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  25.74 
 
 		 461 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  25.74 
 
 		 461 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  25.74 
 
 		 461 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  24.8 
 
 		 461 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  29.62 
 
 		 471 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 461 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  30.54 
 
 		 466 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  25.74 
 
 		 461 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  30.58 
 
 		 466 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  29.62 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  29.08 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  28.88 
 
 		 460 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  26.32 
 
 		 576 aa  92.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  25.58 
 
 		 539 aa  92.4  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.22 
 
 		 467 aa  92  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.22 
 
 		 467 aa  92  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 467 aa  91.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  27.51 
 
 		 455 aa  91.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  30.81 
 
 		 468 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  30.19 
 
 		 465 aa  91.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  23.09 
 
 		 537 aa  91.7  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>