267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_41155 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  100 
 
 		 539 aa  1096    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  57.38 
 
 		 571 aa  590  1e-167  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  34.51 
 
 		 495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  34.82 
 
 		 516 aa  291  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  31.9 
 
 		 516 aa  282  9e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  32.2 
 
 		 576 aa  252  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  31.73 
 
 		 542 aa  248  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  30.25 
 
 		 542 aa  246  4.9999999999999997e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  29.31 
 
 		 532 aa  236  9e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  30.51 
 
 		 514 aa  231  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  31.24 
 
 		 518 aa  225  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  30.19 
 
 		 526 aa  217  5e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  29.14 
 
 		 518 aa  216  5.9999999999999996e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  29.39 
 
 		 520 aa  209  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  29.32 
 
 		 532 aa  204  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  28.51 
 
 		 530 aa  201  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  28.43 
 
 		 526 aa  190  5.999999999999999e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  32.28 
 
 		 507 aa  187  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  26.65 
 
 		 547 aa  182  9.000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.14 
 
 		 527 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  26.74 
 
 		 570 aa  175  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  25.63 
 
 		 519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 528 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  26.02 
 
 		 537 aa  156  9e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  22.51 
 
 		 570 aa  153  8.999999999999999e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.23 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.65 
 
 		 442 aa  134  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475155 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  24.54 
 
 		 502 aa  133  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  27.18 
 
 		 547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.2 
 
 		 517 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  26.03 
 
 		 538 aa  122  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.85 
 
 		 553 aa  121  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 		 514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08198  choline transporter, putative (Eurofung)  29.71 
 
 		 509 aa  115  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.273035  normal  0.278378 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  23.74 
 
 		 544 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  24.25 
 
 		 521 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  24.25 
 
 		 521 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 506 aa  105  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  24.63 
 
 		 521 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 527 aa  103  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  23.78 
 
 		 522 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  25.76 
 
 		 764 aa  95.5  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  23.61 
 
 		 494 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 510 aa  93.6  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  25.47 
 
 		 510 aa  93.6  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  23.06 
 
 		 521 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 530 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 538 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 486 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  24.37 
 
 		 496 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 486 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 486 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  22.25 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  24.56 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  29.28 
 
 		 562 aa  84  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 		 522 aa  84  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 487 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 		 502 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 483 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 483 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  23.58 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  30.14 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  22.61 
 
 		 503 aa  80.1  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 516 aa  80.1  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  30.85 
 
 		 531 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  22.2 
 
 		 543 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  24.63 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  22.6 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  29.05 
 
 		 519 aa  76.6  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  22.46 
 
 		 520 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  27.38 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  22.71 
 
 		 527 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  25.4 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  24.42 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 499 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  24.25 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01702  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0232307  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 539 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  21.59 
 
 		 547 aa  65.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  22.19 
 
 		 461 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  25.18 
 
 		 445 aa  54.3  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  25.18 
 
 		 445 aa  54.3  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  25.18 
 
 		 445 aa  54.3  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  25.18 
 
 		 445 aa  54.3  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  29.17 
 
 		 495 aa  54.3  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  24.29 
 
 		 462 aa  53.9  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  31.29 
 
 		 455 aa  53.9  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  24.4 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  23.77 
 
 		 462 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  23.77 
 
 		 462 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  24.4 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>