More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2391 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 516 aa  1026    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  62.83 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  52.07 
 
 		 510 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  51 
 
 		 530 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  50.8 
 
 		 510 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  48.83 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  48.29 
 
 		 523 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  47.83 
 
 		 543 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  49.32 
 
 		 520 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  33.83 
 
 		 519 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  33.52 
 
 		 528 aa  227  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  33.91 
 
 		 521 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  30.16 
 
 		 514 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  32.7 
 
 		 527 aa  194  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 522 aa  189  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  34.74 
 
 		 514 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  29.47 
 
 		 547 aa  167  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  28.82 
 
 		 526 aa  152  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  26.75 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.64 
 
 		 542 aa  137  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  25.54 
 
 		 571 aa  132  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  26.38 
 
 		 518 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  26.98 
 
 		 505 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 		 538 aa  127  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  28.83 
 
 		 521 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  28.83 
 
 		 521 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  32.05 
 
 		 549 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 494 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  30 
 
 		 513 aa  124  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 531 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 521 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  25.7 
 
 		 764 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  25.85 
 
 		 514 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  25.24 
 
 		 547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  28.01 
 
 		 544 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  25.76 
 
 		 570 aa  109  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  28.82 
 
 		 496 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  23.72 
 
 		 537 aa  108  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  29.02 
 
 		 527 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  22.98 
 
 		 570 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  25.55 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.91 
 
 		 553 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  25.78 
 
 		 538 aa  104  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  26.82 
 
 		 542 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  25.44 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.57 
 
 		 532 aa  101  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  23.15 
 
 		 506 aa  101  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  24.5 
 
 		 502 aa  100  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  23.94 
 
 		 495 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 		 486 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 		 486 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  29.35 
 
 		 562 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 		 486 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  28.73 
 
 		 483 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  28.73 
 
 		 483 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 499 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.81 
 
 		 532 aa  97.4  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  27.32 
 
 		 539 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  27.23 
 
 		 519 aa  96.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 		 487 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  26.1 
 
 		 520 aa  95.9  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  25.75 
 
 		 576 aa  92.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  25.22 
 
 		 505 aa  88.2  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.37 
 
 		 499 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  29.6 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  21.72 
 
 		 547 aa  82.8  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  31.14 
 
 		 503 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  28.13 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  24.27 
 
 		 516 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  22 
 
 		 516 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.92 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  29.53 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.47 
 
 		 527 aa  71.2  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  25.38 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  24.18 
 
 		 518 aa  70.9  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  27.04 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  23.38 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  25.84 
 
 		 480 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 764 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 		 485 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  22.86 
 
 		 507 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  24.13 
 
 		 496 aa  62  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  25.81 
 
 		 465 aa  62  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  24.85 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  22.89 
 
 		 504 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  22.16 
 
 		 576 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  22.16 
 
 		 544 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  24.39 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  23.89 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  22.89 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>