More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3296 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  100 
 
 		 519 aa  1036    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  54.98 
 
 		 528 aa  546  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  50.89 
 
 		 514 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  47.87 
 
 		 514 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  45.44 
 
 		 521 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  40.23 
 
 		 527 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  39.5 
 
 		 522 aa  313  6.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  33.91 
 
 		 510 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  33.91 
 
 		 510 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  33.65 
 
 		 530 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  33.33 
 
 		 526 aa  250  5e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  36.61 
 
 		 543 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  32.71 
 
 		 518 aa  238  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  35.48 
 
 		 515 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  33.9 
 
 		 523 aa  236  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  30.4 
 
 		 570 aa  236  9e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  38.89 
 
 		 520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  31.73 
 
 		 502 aa  230  6e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  33.92 
 
 		 522 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  32.38 
 
 		 530 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  30.84 
 
 		 542 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  33.9 
 
 		 516 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  31.45 
 
 		 576 aa  206  6e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  28.57 
 
 		 495 aa  204  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  27.59 
 
 		 538 aa  204  4e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  27.86 
 
 		 571 aa  202  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  31.72 
 
 		 553 aa  189  7e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  30.74 
 
 		 520 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  27.72 
 
 		 570 aa  184  5.0000000000000004e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  26.73 
 
 		 537 aa  183  8.000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  29.13 
 
 		 547 aa  181  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  29.74 
 
 		 544 aa  179  7e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.57 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  25.63 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  28.79 
 
 		 547 aa  164  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.26 
 
 		 532 aa  164  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  26.81 
 
 		 514 aa  163  8.000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  26.85 
 
 		 516 aa  160  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  28.88 
 
 		 527 aa  157  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 547 aa  157  6e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 		 506 aa  156  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  28.94 
 
 		 521 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  28.92 
 
 		 513 aa  153  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 505 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 		 521 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 		 521 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  28.97 
 
 		 494 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 		 503 aa  147  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  27 
 
 		 764 aa  143  8e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  26.43 
 
 		 542 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 538 aa  136  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.67 
 
 		 442 aa  133  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475155 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  25.2 
 
 		 516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  29.05 
 
 		 527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.88 
 
 		 507 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  24.95 
 
 		 506 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  29.25 
 
 		 531 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 502 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 		 496 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  28.15 
 
 		 499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.65 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  27.95 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  28.15 
 
 		 539 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 		 562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 		 549 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.56 
 
 		 517 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  25.9 
 
 		 518 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  32.88 
 
 		 492 aa  107  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  22.88 
 
 		 526 aa  104  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  24.68 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  26.99 
 
 		 496 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  27.8 
 
 		 519 aa  99.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 497 aa  94.7  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 486 aa  94  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 486 aa  94  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 486 aa  94  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 504 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08198  choline transporter, putative (Eurofung)  23.51 
 
 		 509 aa  80.1  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.273035  normal  0.278378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  26.17 
 
 		 486 aa  70.1  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  22.27 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  23.06 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  26.74 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  24.71 
 
 		 468 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 		 443 aa  67  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  26.21 
 
 		 471 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  26.23 
 
 		 434 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>