More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00510 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND00510  amino acid transporter, putative  100 
 
 		 556 aa  1138    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.100955  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04328  amino acid transporter (Eurofung)  42.5 
 
 		 581 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28502  amino acid permease  38.61 
 
 		 560 aa  372  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.545283  normal  0.640618 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03287  amino acid transporter (Eurofung)  39.32 
 
 		 562 aa  363  4e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836736  hitchhiker  0.00261923 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03876  amino acid transporter (Eurofung)  40.82 
 
 		 547 aa  360  4e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.933819  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09280  amino acid transporter (Eurofung)  38.22 
 
 		 617 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.719179  normal  0.591804 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00800  amino acid transporter, putative  36.13 
 
 		 575 aa  338  9.999999999999999e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00270  amino acid transporter, putative  34.9 
 
 		 572 aa  327  3e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102961  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30939  arginine permease  36.07 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0328856  normal  0.365315 
 
 
-
 
NC_006686  CND02430  amino acid transporter, putative  32.3 
 
 		 548 aa  291  3e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.297208  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84246  arginine permease  31.79 
 
 		 569 aa  286  5e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.385569  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02201  amino acid transporter (Eurofung)  36.16 
 
 		 544 aa  286  5.999999999999999e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000058324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82860  dicarboxylic amino acid permease  31.16 
 
 		 583 aa  274  4.0000000000000004e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.916689  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06118  Amino acid transporter Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2M1L6]  33.46 
 
 		 567 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.889854  normal  0.0238018 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07242  proline transporter, putative (Eurofung)  32.94 
 
 		 546 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.535585 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57189  Proline-specific permease (Proline transport protein)  31.24 
 
 		 570 aa  264  4e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01581  proline transporter (Eurofung)  32.29 
 
 		 519 aa  252  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0103942 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01732  Proline-specific permease (Proline transport protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P18696]  31.11 
 
 		 552 aa  252  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.839394  decreased coverage  0.00801022 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52197  Proline specific permease  32.12 
 
 		 574 aa  251  3e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0650572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32180  general amino acid permease  30.04 
 
 		 554 aa  243  5e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.279338  normal  0.0497012 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05800  amino acid transporter, putative  30.84 
 
 		 563 aa  242  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37009  general amino acid permease  29.28 
 
 		 579 aa  235  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.367656  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03359  proline transporter (Eurofung)  34.09 
 
 		 440 aa  234  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103242  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02468  amino acid transporter (Eurofung)  29.55 
 
 		 533 aa  233  9e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39044  dicarboxylic amino acid permease  29.38 
 
 		 519 aa  231  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.115951 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68755  general amino acid permease  29.66 
 
 		 599 aa  222  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81453  general amino acid permease  29.05 
 
 		 589 aa  216  5.9999999999999996e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0498735 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08279  basic amino acid transporter (Eurofung)  29.14 
 
 		 527 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52358  amino acid permease  31.04 
 
 		 487 aa  214  2.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.676257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1821  lysine-specific permease  30.28 
 
 		 489 aa  212  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  31.1 
 
 		 490 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05678  amino acid transporter (Eurofung)  27.91 
 
 		 588 aa  209  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  30.04 
 
 		 527 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78721  amino acid permease  29.8 
 
 		 597 aa  207  3e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00834318 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44246  dicarboxylic amino acid permease  29.38 
 
 		 532 aa  207  4e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0830188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51094  dicarboxylic amino acid permease  28.48 
 
 		 519 aa  203  6e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.31766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 		 526 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 		 526 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 514 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 526 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  30.43 
 
 		 488 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1489  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 511 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00379868  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  29.5 
 
 		 487 aa  200  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2247  amino acid permease-associated region  31.79 
 
 		 496 aa  199  9e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04649  amino acid transporter (Eurofung)  27.27 
 
 		 553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.410395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 		 526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  28.16 
 
 		 520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  29.48 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  27.95 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  27.95 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  27.95 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  27.95 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  27.95 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  27.95 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 538 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 538 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3322  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 511 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.427023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89811  high-affinity glutamine permease  26.25 
 
 		 568 aa  197  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 511 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  29.08 
 
 		 487 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  29.16 
 
 		 526 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  29.27 
 
 		 512 aa  196  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1448  amino acid permease-associated region  29.53 
 
 		 511 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0115525  hitchhiker  0.00101809 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  30.09 
 
 		 488 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3839  amino acid permease-associated region  28.71 
 
 		 513 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.301841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1929  lysine transporter  29.03 
 
 		 491 aa  196  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.148093  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2396  amino acid transporter  28.07 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  28.45 
 
 		 536 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  29.86 
 
 		 488 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  28.45 
 
 		 511 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  29 
 
 		 488 aa  194  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  29.64 
 
 		 488 aa  193  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  28.94 
 
 		 488 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4928  lysine-specific permease  28.83 
 
 		 510 aa  193  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.382341  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4318  amino acid permease-associated region  28.16 
 
 		 493 aa  193  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.193493  normal  0.498738 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  29.64 
 
 		 488 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  29.64 
 
 		 488 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1856  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.368764 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  29.41 
 
 		 488 aa  192  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  28.72 
 
 		 488 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  28.78 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  27.05 
 
 		 503 aa  191  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  27.05 
 
 		 503 aa  191  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  27.05 
 
 		 503 aa  191  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2323  lysine transporter  29.01 
 
 		 492 aa  190  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3945  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1404  amino acid permease-associated region  29.2 
 
 		 506 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1658  lysine transporter  28.77 
 
 		 491 aa  189  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271465  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4422  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3583  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  27.89 
 
 		 493 aa  189  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  28.17 
 
 		 489 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1773  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 497 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00284908  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2141  amino acid transporter  28.69 
 
 		 510 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.109603 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1739  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 497 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000499031  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4637  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 509 aa  188  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.731379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  28.9 
 
 		 500 aa  187  6e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2418  lysine transporter  28.76 
 
 		 490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  28.4 
 
 		 489 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>