239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0960 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0960  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 446 aa  869    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1373  amino acid permease-associated region  54.55 
 
 		 484 aa  466  9.999999999999999e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0348286 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0964  amino acid permease-associated region  40.82 
 
 		 463 aa  281  1e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.801487  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2246  amino acid permease-associated region  39.7 
 
 		 442 aa  271  1e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1447  amino acid permease-associated region  37.79 
 
 		 420 aa  253  6e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2139  amino acid permease-associated region  37.76 
 
 		 417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.578825  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 526 aa  73.6  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1698  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.471872  normal  0.470522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  23.42 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  23.13 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  24.25 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  27.46 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  24.2 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1095  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.212668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0732  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486551  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1212  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  23.83 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4320  amino acid transporter  25.62 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.619853  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  22.35 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  22.54 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  22.54 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2091  amino acid permease-associated region  25.4 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  22.54 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  22.54 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  22.54 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  26.01 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  21.97 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  21.97 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  21.97 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  21.97 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  21.97 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  21.97 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  21.97 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  21.97 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  21.97 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  23.26 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  22.09 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1095  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  22.59 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  22.14 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1182  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.616059 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  23.68 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  26.7 
 
 		 443 aa  57  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  22.09 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1185  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199623  normal  0.379883 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  25.79 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 493 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  22.09 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  21.35 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4918  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 		 495 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.514357  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  21.35 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  21.35 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  22.11 
 
 		 455 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  24.43 
 
 		 442 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  22.09 
 
 		 443 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 440 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  22.85 
 
 		 450 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  24.44 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  22.09 
 
 		 443 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  23.42 
 
 		 484 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 483 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 453 aa  53.9  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 514 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  24.7 
 
 		 422 aa  53.5  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  23.36 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  24.25 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  26.82 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 487 aa  52.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0588  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.894374  normal  0.71791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5081  amino acid permease-associated region  21.68 
 
 		 467 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0324065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  23.66 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  21.72 
 
 		 456 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  24.17 
 
 		 480 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 481 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  23.45 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2517  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0624875  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1639  amino acid permease-associated region  21.51 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00236467  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  22.27 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>