134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1182 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1182  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 472 aa  918    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.616059 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 485 aa  81.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  23.78 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  28.34 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  23.69 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  23.52 
 
 		 507 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 		 511 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 		 502 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 		 502 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1373  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0348286 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 526 aa  64.7  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  23.29 
 
 		 504 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 490 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1819  amino acid permease-associated region  22.07 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  23.04 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  24.86 
 
 		 528 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  25.37 
 
 		 497 aa  60.1  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  21.55 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  21.55 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  21.55 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  24.29 
 
 		 528 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  22.55 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  20.62 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  23.26 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  22.2 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  23.26 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  22.2 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 501 aa  57  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  24.85 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1984  amino acid permease-associated region  21.58 
 
 		 468 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 485 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  23.22 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  24.28 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  22.82 
 
 		 509 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  23.91 
 
 		 516 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  25.54 
 
 		 449 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  21.31 
 
 		 521 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  26.02 
 
 		 443 aa  53.9  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  20.9 
 
 		 516 aa  53.9  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  27.97 
 
 		 510 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  22.91 
 
 		 482 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  29.11 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  23.93 
 
 		 516 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 494 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0439  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 		 527 aa  52.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  31.62 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0960  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  24.66 
 
 		 449 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  22.02 
 
 		 500 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  23.34 
 
 		 449 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0250  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 		 466 aa  50.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.4961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 477 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  23.53 
 
 		 475 aa  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  23.72 
 
 		 745 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  21.87 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  21.76 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  23.31 
 
 		 455 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2285  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 471 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207466 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2659  amino acid permease family protein  25.48 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.260834  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 		 500 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 490 aa  48.5  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  23.45 
 
 		 566 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  21.51 
 
 		 489 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  21.56 
 
 		 484 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  23.34 
 
 		 527 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 773 aa  47.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  23.02 
 
 		 477 aa  47.4  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 458 aa  47  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  25.96 
 
 		 487 aa  47  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  22.75 
 
 		 512 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  24.34 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  30.08 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 538 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  21.71 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  25.4 
 
 		 496 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  25.4 
 
 		 496 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  24.82 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0964  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 463 aa  45.8  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.801487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2038  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 470 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2214  amino acid permease-associated region  24 
 
 		 469 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2543  amino acid ABC transporter permease  25.79 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0431573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  26.15 
 
 		 485 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1447  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3171  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.12607  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>