105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0964 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0964  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 463 aa  898    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.801487  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0960  amino acid permease-associated region  41.32 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1373  amino acid permease-associated region  38.43 
 
 		 484 aa  263  4.999999999999999e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0348286 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1447  amino acid permease-associated region  33.94 
 
 		 420 aa  203  6e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2246  amino acid permease-associated region  33.55 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2139  amino acid permease-associated region  33.11 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.578825  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  28.49 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  23.45 
 
 		 526 aa  60.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  24.1 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  23.92 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 418 aa  56.6  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1182  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.616059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 		 485 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 456 aa  54.7  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0588  amino acid permease-associated region  29.65 
 
 		 434 aa  53.9  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.894374  normal  0.71791 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  24.18 
 
 		 447 aa  53.9  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 462 aa  53.5  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 462 aa  53.5  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0325  amino acid permease-associated region  23.22 
 
 		 462 aa  53.1  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  26.54 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 462 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  24.61 
 
 		 411 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01659  amino acid transporter (Eurofung)  23.71 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00286365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 487 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1819  amino acid permease-associated region  23.76 
 
 		 474 aa  51.6  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0507  amino acid transporter  22.55 
 
 		 524 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.229334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1984  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 468 aa  51.2  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  24.07 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 455 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 521 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  27.88 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1373  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000761845  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 487 aa  49.7  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 462 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  21.47 
 
 		 490 aa  49.3  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 521 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 521 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  24.82 
 
 		 468 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  21.74 
 
 		 454 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  23.24 
 
 		 443 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0906  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 468 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  24.29 
 
 		 468 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 484 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 468 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  28.37 
 
 		 443 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2285  amino acid permease-associated region  23.19 
 
 		 471 aa  47  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207466 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2659  amino acid permease family protein  23.19 
 
 		 468 aa  47  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.260834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  24.53 
 
 		 473 aa  47  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5356  gamma-aminobutyrate permease  24.46 
 
 		 463 aa  47  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  24.34 
 
 		 412 aa  47  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 455 aa  46.6  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1041  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 467 aa  46.6  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000184403  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  24.56 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  22.63 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  23.24 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  23.18 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  23.02 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  20.88 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  24.53 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  23.43 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  24.53 
 
 		 475 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  28.79 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  23.03 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  28.79 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  28.79 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  28.79 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  28.79 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  28.79 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  23.35 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4918  amino acid permease-associated region  30.1 
 
 		 495 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.514357  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  23.35 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  28.79 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  28.79 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  23.71 
 
 		 445 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 511 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  23.57 
 
 		 516 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 502 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  23.53 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 		 443 aa  44.3  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0313  GABA permease  23.75 
 
 		 463 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 453 aa  43.9  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 472 aa  43.9  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 472 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 437 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  22.46 
 
 		 453 aa  43.9  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  23.73 
 
 		 502 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 464 aa  43.9  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  23.14 
 
 		 443 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>