26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0588 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0588  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 434 aa  835    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.894374  normal  0.71791 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0250  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.4961 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0924  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 526 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 		 447 aa  51.2  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  25.37 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  25.1 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1733  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204884 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  29.78 
 
 		 463 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  32.93 
 
 		 485 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.91 
 
 		 450 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 		 462 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 		 462 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 		 462 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  23.4 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  24.34 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  25.57 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0960  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0964  amino acid permease-associated region  29.65 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.801487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 		 506 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  25.46 
 
 		 456 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 459 aa  43.5  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2139  amino acid permease-associated region  30.25 
 
 		 417 aa  43.5  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.578825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>