More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0409 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 526 aa  1050    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  31.52 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1984  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 468 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 492 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 492 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 475 aa  107  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 491 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 461 aa  87.4  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1819  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 474 aa  87.4  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 495 aa  80.5  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  22.34 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 		 456 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  30 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  29.07 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 487 aa  75.1  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1476  amino acid transporter  24.94 
 
 		 447 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.161402 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  23.96 
 
 		 447 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  0.0000000124915 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0924  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1792  amino acid transporter  24.63 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000593149  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 493 aa  72  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 513 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1963  amino acid transporter  24.39 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.041678  hitchhiker  0.00000000765672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 467 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1492  amino acid transporter  26.44 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.0000000000000168224 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0250  amino acid permease-associated region  23.28 
 
 		 466 aa  69.7  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.4961 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2517  amino acid permease-associated region  30.13 
 
 		 463 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0624875  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  23.28 
 
 		 485 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 		 484 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0960  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  23.21 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  26.05 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  27.44 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2421  amino acid permease family protein  29.77 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  22.27 
 
 		 521 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  22.25 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3082  amino acid permease  29.11 
 
 		 463 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  22.77 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  20.24 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  26.95 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 485 aa  64.3  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  23.51 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  29.31 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 510 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  31.11 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  31.11 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  31.11 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  31.11 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  31.85 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  31.11 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  31.11 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 490 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  31.11 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  31.85 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  31.85 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  31.11 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  31.11 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  31.85 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  31.85 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  26.32 
 
 		 431 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  26.32 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  24.93 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  26.32 
 
 		 431 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  22.73 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  28.85 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  24.53 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  30.73 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  23 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  25.1 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  24.8 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  24.69 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  25.1 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>