62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0924 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0924  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 466 aa  915    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0250  amino acid permease-associated region  57.05 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.4961 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 526 aa  81.6  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  22.54 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  22.54 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  22.54 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1984  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 		 468 aa  56.6  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0588  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.894374  normal  0.71791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 450 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  29.11 
 
 		 465 aa  53.5  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 		 506 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  23.51 
 
 		 450 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  23.51 
 
 		 450 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  21.4 
 
 		 501 aa  51.2  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  22.35 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  30.99 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 522 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  20.53 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 		 538 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 455 aa  47.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 433 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  22.46 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  22.89 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  23.08 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 527 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  26.09 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0960  amino acid permease-associated region  23.72 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  24.18 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  29.61 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  23.73 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  28.65 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2285  amino acid permease-associated region  24.8 
 
 		 471 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  28.83 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  22.81 
 
 		 497 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  27.01 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2659  amino acid permease family protein  24.8 
 
 		 468 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.260834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 549 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  31.97 
 
 		 469 aa  44.3  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  23.02 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2616  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 		 464 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923502  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  28.68 
 
 		 471 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  28.68 
 
 		 471 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  28.68 
 
 		 471 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2010  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 468 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2416  amino acid permease-associated region  46.67 
 
 		 461 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618668  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  28 
 
 		 452 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  28 
 
 		 452 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  28 
 
 		 452 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  28 
 
 		 452 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  28 
 
 		 452 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 452 aa  43.5  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  28.12 
 
 		 452 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  28.12 
 
 		 452 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  28.12 
 
 		 452 aa  43.5  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  28.12 
 
 		 452 aa  43.5  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  28.12 
 
 		 452 aa  43.5  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 452 aa  43.5  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  28.12 
 
 		 452 aa  43.5  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  28.12 
 
 		 452 aa  43.5  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>