More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1492 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 431 aa  840    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  28.73 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0779  amino acid permease-associated region  30.98 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.047573  normal  0.0991739 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0055  amino acid permease-associated region  31.3 
 
 		 428 aa  149  9e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.195903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0608  amino acid permease-associated region  31.62 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1335  amino acid permease-associated region  33.15 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.654483 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0974  amino acid permease-associated region  31.09 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.11694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 521 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  27.18 
 
 		 636 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  28.13 
 
 		 439 aa  113  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 490 aa  113  6e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.96 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  25.96 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  28.06 
 
 		 471 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  28.06 
 
 		 471 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25.96 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.96 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  26.52 
 
 		 460 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  27.62 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.62 
 
 		 471 aa  107  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.96 
 
 		 467 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27.51 
 
 		 467 aa  106  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25.73 
 
 		 467 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.87 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.87 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25.87 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  26.09 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  27.43 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 		 745 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  26.09 
 
 		 471 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  30.08 
 
 		 486 aa  103  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  26.57 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  28.02 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  25.65 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  26.64 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  26.63 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 		 517 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  25.65 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.83 
 
 		 489 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  25.96 
 
 		 467 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 492 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 501 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  26.79 
 
 		 465 aa  97.1  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 496 aa  97.1  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 469 aa  96.7  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 		 464 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 549 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  23.92 
 
 		 486 aa  95.9  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  25.92 
 
 		 482 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 		 486 aa  94.4  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 		 476 aa  94  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 		 465 aa  93.2  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  25.32 
 
 		 468 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 		 466 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 517 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 		 475 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 466 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 468 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 466 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 456 aa  92.4  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  27.14 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 468 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 468 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.54 
 
 		 471 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  28.13 
 
 		 489 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  26.25 
 
 		 542 aa  90.9  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 		 491 aa  90.5  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 764 aa  90.1  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 		 476 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 549 aa  89.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2910  UspA domain protein  24.61 
 
 		 649 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12405  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  23.64 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 466 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  26.53 
 
 		 488 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 436 aa  89  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 		 482 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  27.5 
 
 		 506 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 		 482 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  30.4 
 
 		 792 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  26.41 
 
 		 543 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  26.68 
 
 		 463 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  26.75 
 
 		 463 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  26.1 
 
 		 441 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 465 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.28 
 
 		 471 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.28 
 
 		 471 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.28 
 
 		 471 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.28 
 
 		 471 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.28 
 
 		 471 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  27.03 
 
 		 486 aa  87.4  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  27.03 
 
 		 486 aa  87.4  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 461 aa  87  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 467 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 		 513 aa  86.7  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  25.44 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  25.46 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>