More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0779 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0779  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 427 aa  835    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.047573  normal  0.0991739 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0608  amino acid permease-associated region  50 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0055  amino acid permease-associated region  51.61 
 
 		 428 aa  396  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.195903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1335  amino acid permease-associated region  52.49 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.654483 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0974  amino acid permease-associated region  52.11 
 
 		 438 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.11694 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  30.98 
 
 		 431 aa  163  6e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 455 aa  113  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  25.11 
 
 		 636 aa  83.2  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2910  UspA domain protein  25.39 
 
 		 649 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12405  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  23.93 
 
 		 521 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  26.06 
 
 		 466 aa  70.1  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  23.44 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  23 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  26.81 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  22.73 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  26.81 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  26.81 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  26.81 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  26.81 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  26.81 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  26.81 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  24.56 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  25.72 
 
 		 468 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 463 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  26.33 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  23.64 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  23.23 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  21.41 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0074  amino acid permease family protein  22.67 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  21.98 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  24.4 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  23.29 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 517 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 		 506 aa  63.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  23.73 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  21.44 
 
 		 467 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  24.45 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  24.34 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  26.23 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  24 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  25.19 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 481 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  21.5 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 503 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  24.28 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  22.99 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  23.99 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  23.58 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  23.99 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  23.58 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 518 aa  61.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  21.66 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  26.78 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 		 518 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  24.07 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  22.58 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  23.92 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0344  amino acid permease family protein  26.34 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  23.48 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  25.37 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  23.63 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  21.95 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 		 745 aa  59.7  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  22.75 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  23.47 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  22.75 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  23.32 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  22.68 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  29.32 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  22.68 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  22.68 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  23.63 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  22.68 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  26.9 
 
 		 518 aa  58.9  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  26.9 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  23.44 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  24.03 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  22.68 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  23.63 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>