More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1373 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1373  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 484 aa  956    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0348286 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0960  amino acid permease-associated region  55.37 
 
 		 446 aa  458  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0964  amino acid permease-associated region  38.43 
 
 		 463 aa  271  2e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.801487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1447  amino acid permease-associated region  35.94 
 
 		 420 aa  244  3e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2246  amino acid permease-associated region  37.53 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2139  amino acid permease-associated region  33.8 
 
 		 417 aa  211  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.578825  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  24.46 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  24.63 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  25.72 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  23.23 
 
 		 434 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  22.74 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  27.27 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  23.04 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1182  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.616059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  27.11 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 530 aa  64.7  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  22.87 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  25.76 
 
 		 497 aa  63.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  28.4 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  23.1 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1639  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00236467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  23.61 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  26.4 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  24.6 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  22.9 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  25.73 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  23.69 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  30.58 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  23.83 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  24.73 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  27.06 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  24.12 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 468 aa  57  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 		 463 aa  57  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 481 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 		 462 aa  57  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.07 
 
 		 467 aa  57  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  29.75 
 
 		 451 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  25.07 
 
 		 467 aa  57  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  29.75 
 
 		 451 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  22.39 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  23.13 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  25.98 
 
 		 462 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 526 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1335  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.654483 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25 
 
 		 467 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  25.95 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  22.52 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  22.91 
 
 		 506 aa  55.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  22.52 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  22.52 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  22.52 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  22.52 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.66 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 518 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  27.72 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25 
 
 		 467 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  22.89 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0719  amino acid permease family protein  23.27 
 
 		 469 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.544014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  22.89 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  22.89 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0588  amino acid permease-associated region  30.04 
 
 		 434 aa  55.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.894374  normal  0.71791 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0867  amino acid permease-associated region  23.27 
 
 		 469 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  23.71 
 
 		 426 aa  55.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  22.83 
 
 		 471 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 		 501 aa  54.3  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  22.89 
 
 		 473 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  23.35 
 
 		 449 aa  54.7  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0408  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 		 410 aa  54.7  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  22.28 
 
 		 452 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  22.28 
 
 		 452 aa  54.3  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  23.64 
 
 		 493 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  22.28 
 
 		 452 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>