More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1819 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1984  amino acid permease-associated region  75.74 
 
 		 468 aa  718    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1819  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 474 aa  929    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 492 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 492 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 526 aa  100  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 461 aa  94.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  26.45 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  22.94 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  27.32 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  23.26 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 		 521 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.89 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  23.89 
 
 		 487 aa  62.4  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  30.4 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  24.18 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  24.18 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  24.9 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  29.81 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  25.82 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  29.52 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  29.52 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  28.62 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  29.52 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  29.52 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  35.38 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  28.92 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  28.92 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  28.92 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.79 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  23.89 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.79 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.79 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1182  amino acid permease-associated region  22.07 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.616059 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  25.07 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  30.81 
 
 		 475 aa  57  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  22.07 
 
 		 485 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  23.93 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  23.4 
 
 		 463 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  26.56 
 
 		 468 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  24.51 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 464 aa  56.6  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  24.79 
 
 		 471 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  28.77 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 487 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02201  amino acid transporter (Eurofung)  29.45 
 
 		 544 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000058324  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  24.79 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4905  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 467 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.963785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5031  amino acid ABC transporter permease  25.65 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  30.5 
 
 		 462 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1820  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 482 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 482 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  24.51 
 
 		 471 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  23.34 
 
 		 486 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3470  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 561 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0308593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 473 aa  54.3  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  21.82 
 
 		 473 aa  53.9  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5194  putrescine transporter  29.55 
 
 		 452 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1306  amino acid permease  28.8 
 
 		 458 aa  53.9  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000234157  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 		 458 aa  53.9  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 507 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  29.17 
 
 		 473 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4834  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 458 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.558883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2091  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 455 aa  53.5  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 		 447 aa  53.5  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1740  amino acid permease-associated region  24.9 
 
 		 493 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  26.4 
 
 		 483 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  28.19 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  25.1 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  31.09 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67310  putative amino acid permease  27.76 
 
 		 467 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4136  amino acid permease family protein  24.72 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210777  normal  0.0802051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  28.57 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  28.57 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43398  APC family transporter: amino acid  29.61 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  28.57 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  28.57 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0078  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  23.98 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  23.88 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  28.57 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4084  amino acid permease family protein  24.72 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  28.57 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>