More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0653 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  100 
 
 		 472 aa  921    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  40.19 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  36.6 
 
 		 464 aa  296  6e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  33.89 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  34.75 
 
 		 455 aa  237  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  31.46 
 
 		 465 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  30.51 
 
 		 500 aa  203  6e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  30.95 
 
 		 497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  29.08 
 
 		 500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  28.7 
 
 		 473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  28.15 
 
 		 467 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  28.15 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  24.95 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  26.87 
 
 		 464 aa  156  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  26.87 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  24.95 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  24.95 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  24.95 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  24.9 
 
 		 473 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 		 495 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  26.27 
 
 		 474 aa  141  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  26.27 
 
 		 474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  26.29 
 
 		 511 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  26.29 
 
 		 511 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  26.29 
 
 		 511 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  26.29 
 
 		 511 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  26.29 
 
 		 511 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  26.29 
 
 		 511 aa  133  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  26.29 
 
 		 511 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  26.29 
 
 		 511 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  25.4 
 
 		 472 aa  132  9e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  26.29 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  25.17 
 
 		 472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 480 aa  128  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  23.43 
 
 		 494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  27.25 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  27.25 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  23.7 
 
 		 475 aa  124  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  24.84 
 
 		 470 aa  123  8e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  24.84 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  23.72 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  23.28 
 
 		 475 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  23.69 
 
 		 499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  23.17 
 
 		 508 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  24.46 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 720 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  24.22 
 
 		 485 aa  106  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  23.6 
 
 		 506 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  25.85 
 
 		 503 aa  104  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  23.95 
 
 		 506 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  24.12 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  22.01 
 
 		 495 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  27.03 
 
 		 489 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  26.76 
 
 		 489 aa  95.1  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  23.29 
 
 		 511 aa  92.4  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  24.94 
 
 		 476 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  23.76 
 
 		 494 aa  90.9  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  23.12 
 
 		 495 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  22.72 
 
 		 495 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1695  amino acid transporter  24.24 
 
 		 480 aa  85.1  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00330646  decreased coverage  1.25344e-25 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1980  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 		 504 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1999  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 		 504 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0525134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2045  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 		 504 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1212  amino acid permease yshA  21.74 
 
 		 498 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0367716  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1400  amino acid permease family protein  21.92 
 
 		 498 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00116878  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2217  amino acid permease-associated region  23.16 
 
 		 503 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3834  amino acid permease-associated region  21.8 
 
 		 514 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4126  amino acid permease-associated region  23.16 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.635081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4715  amino acid permease family protein  21.61 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.212622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03990  hypothetical protein  21.53 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.826607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04028  predicted transporter  21.8 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.853032  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4400  amino acid permease family protein  21.8 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5674  amino acid permease family protein  21.8 
 
 		 514 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270283  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3854  amino acid permease-associated region  21.3 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1311  amino acid transporter  22.61 
 
 		 516 aa  76.6  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3036  amino acid transporter  23.2 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0805799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4627  amino acid permease family protein  21.57 
 
 		 514 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.592733  normal  0.0531629 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  24.35 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  24.35 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  24.35 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  24.35 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1995  amino acid transporter  22.27 
 
 		 507 aa  74.7  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0293042  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  28.72 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4706  inner membrane transporter YjeM  22.88 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.929482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1034  amino acid permease family protein  23.19 
 
 		 540 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.696759  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2492  lysine/cadaverine antiporter  24.6 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  24.09 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  30.61 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  23.7 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3768  lysine/cadaverine antiporter  25 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000519797  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4763  inner membrane transporter YjeM  22.65 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.520052 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1217  amino acid permease family protein  22.95 
 
 		 540 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0249423  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4623  inner membrane transporter YjeM  22.65 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4615  inner membrane transporter YjeM  22.65 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  25.95 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>