More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2659 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2285  amino acid permease-associated region  99.79 
 
 		 471 aa  908    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207466 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2659  amino acid permease family protein  100 
 
 		 468 aa  909    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.260834  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 497 aa  154  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 		 506 aa  150  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 		 501 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 490 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 482 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 461 aa  96.7  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  29.43 
 
 		 477 aa  92  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  27.22 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 		 506 aa  87.8  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 		 464 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  27.42 
 
 		 449 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  24.3 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 449 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  26.74 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  24.58 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  27.33 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  26.75 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  24 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 		 495 aa  72  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  24.61 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3130  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67310  putative amino acid permease  26.89 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  25.72 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  27.04 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  26.19 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  26.71 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  23.32 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  27.5 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  26.25 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  24.28 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  27.3 
 
 		 464 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  25.51 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  25.51 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1095  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.212668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  25.51 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  25.51 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  22.87 
 
 		 449 aa  66.6  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  25.51 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  25.51 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  23.87 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  28.12 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  23.87 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  25.53 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  23.87 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  23.87 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  25.51 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  25.6 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1095  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  23.87 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  23.87 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  23.87 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  23.25 
 
 		 521 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  23.87 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  23.87 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  23.87 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  23.59 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  23.87 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  23.87 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  23.97 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4320  amino acid transporter  24.58 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.619853  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  25.28 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>