More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2580 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  100 
 
 
464 aa  877    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  29.96 
 
 
501 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  28.91 
 
 
497 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 
490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 
506 aa  143  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  29.78 
 
 
482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  32.37 
 
 
506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2285  amino acid permease-associated region  28.16 
 
 
471 aa  97.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207466 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2659  amino acid permease family protein  28.08 
 
 
468 aa  97.1  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.260834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 
521 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  30.07 
 
 
485 aa  88.2  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 
479 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 
479 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 
484 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  28.32 
 
 
486 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3130  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 
460 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  25.99 
 
 
497 aa  85.9  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  29.81 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  22.78 
 
 
489 aa  84.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  25.5 
 
 
470 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 
507 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 
461 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 
449 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 
464 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 
495 aa  82.4  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 
491 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 
517 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  25.13 
 
 
464 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 
475 aa  79.7  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  26.83 
 
 
460 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 
468 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  26.9 
 
 
468 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 
468 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  27.01 
 
 
476 aa  79.3  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 
468 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 
457 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 
465 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1516  amino acid permease  25.36 
 
 
454 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  24.08 
 
 
482 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1385  amino acid transporter  25.36 
 
 
454 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351329  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  24.08 
 
 
482 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  26.07 
 
 
479 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  26.9 
 
 
466 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 
447 aa  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 
549 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  25.26 
 
 
464 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  24.59 
 
 
467 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  28.22 
 
 
477 aa  77.4  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0467  amino acid transporter  25.12 
 
 
454 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00613549  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1381  amino acid transporter  25.12 
 
 
454 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.568485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1185  amino acid transporter  25.12 
 
 
454 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  28 
 
 
474 aa  77  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1774  amino acid permease  25.12 
 
 
454 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.186196  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0685  amino acid transporter  25.12 
 
 
454 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0485493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 
483 aa  77  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 
493 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 
476 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 
463 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  28.46 
 
 
477 aa  77  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 
466 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 
466 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 
494 aa  76.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 
511 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 
538 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  24.9 
 
 
492 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 
502 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 
492 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  28.04 
 
 
489 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 
463 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 
497 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 
491 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 
502 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 
492 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  24.67 
 
 
463 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  25.24 
 
 
454 aa  75.1  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  27.93 
 
 
469 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  30.68 
 
 
509 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  27.16 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 
486 aa  74.7  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  25.08 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.26 
 
 
467 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 
482 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  27.02 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25.26 
 
 
467 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25.26 
 
 
467 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  25.61 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.26 
 
 
467 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01910  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  26.23 
 
 
488 aa  73.6  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  23.45 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 
490 aa  73.2  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2854  amino acid permease  24.46 
 
 
454 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0237037  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  23.45 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 
504 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  25.75 
 
 
479 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  23.45 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25 
 
 
467 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>