More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3754 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 485 aa  928    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  33.61 
 
 		 483 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  34.19 
 
 		 479 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  34.19 
 
 		 479 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  34.22 
 
 		 484 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  31.2 
 
 		 467 aa  227  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  32.26 
 
 		 484 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  29.67 
 
 		 504 aa  217  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  35.94 
 
 		 488 aa  216  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  35.11 
 
 		 497 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  34.19 
 
 		 495 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  34.15 
 
 		 485 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  33.13 
 
 		 509 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  33.97 
 
 		 510 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  34.38 
 
 		 485 aa  204  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 		 509 aa  202  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  36.88 
 
 		 485 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 510 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 510 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  34.73 
 
 		 486 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  29.4 
 
 		 510 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  32.66 
 
 		 498 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  30.85 
 
 		 493 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  33.12 
 
 		 487 aa  192  9e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  27.84 
 
 		 513 aa  192  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  29.71 
 
 		 464 aa  192  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  29.56 
 
 		 516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  28.97 
 
 		 510 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  31.12 
 
 		 481 aa  190  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  35.12 
 
 		 497 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  32.06 
 
 		 490 aa  186  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  34.24 
 
 		 502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  32.41 
 
 		 516 aa  176  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  31.64 
 
 		 486 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  34.47 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  28.98 
 
 		 474 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  31.75 
 
 		 496 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  31.3 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  30.39 
 
 		 504 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  32.26 
 
 		 489 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  29.75 
 
 		 507 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 		 461 aa  92.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 511 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 502 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  29.97 
 
 		 502 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 501 aa  89.7  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  30.36 
 
 		 507 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 492 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 492 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 492 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 497 aa  80.1  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 506 aa  74.3  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 491 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  28.29 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1182  amino acid permease-associated region  26.89 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.616059 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  29.19 
 
 		 491 aa  67  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  27.01 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 521 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0539  amino acid permease-associated region  29.85 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  27.84 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3459  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  26.89 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4907  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5379  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0243202  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2214  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 469 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  26.27 
 
 		 468 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 465 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 538 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  28.19 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1185  amino acid permease-associated region  35.2 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199623  normal  0.379883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 465 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13282  cationic amino acid transport integral membrane protein  26.47 
 
 		 495 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.260226 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0732  amino acid permease-associated region  35.2 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486551  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1095  amino acid permease-associated region  35.2 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1212  amino acid permease-associated region  35.2 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2091  amino acid permease-associated region  35.2 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  26.45 
 
 		 526 aa  55.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1095  amino acid permease-associated region  35.2 
 
 		 455 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.212668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 482 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4320  amino acid transporter  35.2 
 
 		 455 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.619853  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 486 aa  54.7  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 		 440 aa  54.7  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 472 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 472 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  30.73 
 
 		 488 aa  53.9  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  22.64 
 
 		 513 aa  53.5  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2283  amino acid permease  27.56 
 
 		 476 aa  53.9  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4407  amino acid ABC transporter permease  29.94 
 
 		 460 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0417319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 472 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>