More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5379 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4407  amino acid ABC transporter permease  78.08 
 
 		 460 aa  725    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0417319 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5379  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 459 aa  916    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0243202  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0786  amino acid tranporter  94.99 
 
 		 459 aa  877    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal  0.194759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3973  amino acid permease-associated region  78.3 
 
 		 455 aa  711    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3459  amino acid permease-associated region  99.56 
 
 		 459 aa  915    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4907  amino acid permease-associated region  99.56 
 
 		 459 aa  915    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1447  amino acid permease-associated region  78.08 
 
 		 460 aa  727    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3489  GABA permease  43.18 
 
 		 464 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3751  GABA permease  42.95 
 
 		 487 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00254323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3893  amino acid permease-associated region  42.6 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.375275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3774  GABA permease  43.18 
 
 		 464 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3823  GABA permease  42.95 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4133  amino acid permease-associated region  45.15 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3570  GABA permease  42.95 
 
 		 464 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3468  gamma-aminobutyrate permease  42.95 
 
 		 464 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3482  gamma-aminobutyrate permease  42.95 
 
 		 464 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3853  GABA permease  42.95 
 
 		 464 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.261193  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1317  GABA permease  41.9 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.319742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1479  GABA permease  42.73 
 
 		 449 aa  346  5e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10983  hitchhiker  0.00182133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0284  GABA permease  40.88 
 
 		 461 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  hitchhiker  0.000157703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0302  GABA permease  40.88 
 
 		 461 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0307  GABA permease  40.66 
 
 		 461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0906  amino acid permease-associated region  41.61 
 
 		 468 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3609  GABA transporter  39.35 
 
 		 463 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4926  GABA permease  40.48 
 
 		 461 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015996 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2583  GABA permease  39.17 
 
 		 463 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0522  GABA permease  39.17 
 
 		 463 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0494  GABA permease  39.17 
 
 		 463 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2921  GABA permease  39.61 
 
 		 463 aa  323  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84822  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5356  gamma-aminobutyrate permease  40.13 
 
 		 463 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0686  beta-alanine/gamma-aminobutyrate-H+ symporter  40.09 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4909  GABA permease  39.69 
 
 		 463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0452  GABA permease  38.73 
 
 		 463 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131648  normal  0.0220043 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3218  gamma-aminobutyrate transporter  38.86 
 
 		 466 aa  319  7e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2523  amino acid permease-associated region  43.33 
 
 		 464 aa  319  7.999999999999999e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4364  amino acid permease-associated region  40.17 
 
 		 476 aa  318  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2943  gamma-aminobutyrate transporter  38.86 
 
 		 466 aa  318  9e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2876  GABA permease  40.27 
 
 		 463 aa  318  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975083  normal  0.127052 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1020  GABA permease  38.86 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2798  gamma-aminobutyrate transporter  38.86 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2783  gamma-aminobutyrate transporter  38.86 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.414998 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1043  gamma-aminobutyrate transporter  38.86 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2616  amino acid permease-associated region  39.29 
 
 		 464 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923502  normal  0.46243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02519  gamma-aminobutyrate transporter  38.86 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02483  hypothetical protein  38.86 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3905  gamma-aminobutyrate transporter  38.86 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.667666 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2938  gamma-aminobutyrate transporter  38.26 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.111546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0426  GABA permease  39.01 
 
 		 463 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2906  gamma-aminobutyrate transporter  38.26 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2911  GABA permease  38.84 
 
 		 463 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.582601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2973  gamma-aminobutyrate transporter  38.26 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  0.0482196 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2990  gamma-aminobutyrate transporter  38.26 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3095  gamma-aminobutyrate transporter  38.26 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2780  GABA permease  38.62 
 
 		 463 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2872  GABA permease  38.37 
 
 		 463 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3572  GABA permease  39.78 
 
 		 467 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0956  GABA permease  39.78 
 
 		 467 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1926  GABA permease  39.78 
 
 		 467 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.620655  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0660  GABA permease  39.78 
 
 		 467 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3590  GABA permease  39.78 
 
 		 541 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.566491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3600  GABA permease  39.78 
 
 		 587 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3753  amino acid permease-associated region  40.36 
 
 		 478 aa  312  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0515  GABA permease  39.56 
 
 		 467 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10533  gaba permease gabP (4-amino butyrate transport carrier)  39.68 
 
 		 434 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6223  amino acid permease-associated region  39.87 
 
 		 481 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2293  GABA permease  39.73 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0313  GABA permease  40 
 
 		 463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1998  amino acid permease-associated region  39.65 
 
 		 608 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.89102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0122  amino acid permease-associated region  41.52 
 
 		 606 aa  305  8.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4525  amino acid permease-associated region  39.96 
 
 		 473 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.411369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2021  amino acid permease-associated region  39.24 
 
 		 480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3382  amino acid permease-associated region  39.08 
 
 		 606 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3371  amino acid permease-associated region  39.08 
 
 		 606 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3433  amino acid permease-associated region  39.08 
 
 		 606 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3002  amino acid permease-associated region  37.94 
 
 		 455 aa  300  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.993611  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4114  GABA permease  40 
 
 		 463 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3570  amino acid permease-associated region  39.1 
 
 		 460 aa  298  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3734  GABA permease  50.33 
 
 		 309 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9528e-18 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4765  amino acid permease-associated region  37.69 
 
 		 463 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02211  amino acid transporter  39.59 
 
 		 462 aa  296  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  36.36 
 
 		 513 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0667  amino acid permease-associated region  37.91 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.450649  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4627  amino acid permease-associated region  37.69 
 
 		 463 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000229605 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  36.14 
 
 		 474 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1805  amino acid permease-associated region  39.77 
 
 		 469 aa  294  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607317  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  36.14 
 
 		 474 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2002  amino acid transporter  40.53 
 
 		 473 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2325  amino acid permease-associated region  36.28 
 
 		 476 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000716314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  36.14 
 
 		 474 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  36.14 
 
 		 478 aa  293  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  35.92 
 
 		 474 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4756  amino acid permease  37.47 
 
 		 463 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000433889  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3380  amino acid permease-associated region  38.46 
 
 		 460 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  36.82 
 
 		 472 aa  292  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0205  gamma-aminobutyrate permease  40 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01580  gamma-aminobutyrate permease  40 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.683743  normal  0.83882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2214  amino acid permease-associated region  37.08 
 
 		 469 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2716  amino acid permease; arginine permease  35.7 
 
 		 474 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000134476  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3679  amino acid permease-associated region  38.34 
 
 		 460 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.720671  hitchhiker  0.00000622895 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  35.31 
 
 		 472 aa  289  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>