More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2722 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 486 aa  922    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  53.29 
 
 		 492 aa  440  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  47.11 
 
 		 485 aa  356  5e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  47.03 
 
 		 485 aa  345  8.999999999999999e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  50.23 
 
 		 498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  40.17 
 
 		 479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  40.17 
 
 		 479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  40.17 
 
 		 484 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  39.57 
 
 		 483 aa  306  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  43.53 
 
 		 495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  35.27 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  39.57 
 
 		 493 aa  289  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  42.46 
 
 		 497 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  37.77 
 
 		 487 aa  280  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  38.06 
 
 		 464 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  46.51 
 
 		 483 aa  276  7e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  43.03 
 
 		 497 aa  273  7e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  41.15 
 
 		 509 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  38.89 
 
 		 516 aa  267  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  40.04 
 
 		 484 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  39.75 
 
 		 509 aa  264  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  37.85 
 
 		 485 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  39.96 
 
 		 510 aa  263  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  37.63 
 
 		 486 aa  260  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  32.71 
 
 		 516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  40.51 
 
 		 491 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  38 
 
 		 488 aa  243  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 496 aa  242  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  37 
 
 		 490 aa  238  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  32.7 
 
 		 510 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  32.7 
 
 		 510 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  32.7 
 
 		 510 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  34.43 
 
 		 504 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  39.04 
 
 		 502 aa  231  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 		 510 aa  231  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  31.68 
 
 		 513 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  35.67 
 
 		 485 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  32.6 
 
 		 481 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  32.91 
 
 		 527 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  32.4 
 
 		 474 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 504 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  32.56 
 
 		 507 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 		 461 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 502 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 511 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 502 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 469 aa  94  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  29.27 
 
 		 507 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 475 aa  89.7  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  23.28 
 
 		 490 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  30.08 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  30.26 
 
 		 506 aa  79.7  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  29.15 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  24.39 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  25.06 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 487 aa  73.2  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  24.58 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  24.13 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  25.41 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2659  amino acid permease family protein  26.18 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.260834  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 526 aa  70.9  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2285  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 471 aa  70.5  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  23.56 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  23.82 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  28.25 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  26.5 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  26.54 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  25.4 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  28.69 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  24.88 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  25.12 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  25.06 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  25.06 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  25.17 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  23.49 
 
 		 521 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  25.53 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  26.12 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  24.89 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  24.88 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  23.98 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  23.81 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  25.12 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>