More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3178 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 502 aa  983    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  49.2 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  48.88 
 
 		 510 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  45.34 
 
 		 490 aa  388  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  40.34 
 
 		 495 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  38.61 
 
 		 509 aa  296  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 504 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  42.46 
 
 		 507 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  35.37 
 
 		 479 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  35.37 
 
 		 479 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  35.95 
 
 		 484 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  36.82 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  31.58 
 
 		 483 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  35.07 
 
 		 484 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  32.3 
 
 		 485 aa  227  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  32.66 
 
 		 467 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  38.69 
 
 		 486 aa  219  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  38.39 
 
 		 497 aa  219  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  37.22 
 
 		 497 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  32.83 
 
 		 464 aa  210  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  32.91 
 
 		 488 aa  209  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  34.24 
 
 		 485 aa  206  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  31.87 
 
 		 516 aa  206  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  33.49 
 
 		 485 aa  206  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  31.07 
 
 		 481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  32.92 
 
 		 487 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  31.74 
 
 		 486 aa  186  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  33.16 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  30.18 
 
 		 491 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  30.83 
 
 		 513 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  30.73 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  30.65 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  30.65 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  31.53 
 
 		 496 aa  166  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  31.41 
 
 		 483 aa  166  9e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  31.16 
 
 		 510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  28.84 
 
 		 493 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  29.27 
 
 		 516 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 504 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 		 498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  29.7 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 		 527 aa  123  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 461 aa  87.8  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  23.46 
 
 		 491 aa  77  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  29.19 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 507 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 		 511 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  24.44 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  25.62 
 
 		 434 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  23.79 
 
 		 521 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  20.96 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  22.38 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  22.38 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  22.38 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  21.17 
 
 		 459 aa  62  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  23.38 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  21.53 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  22.46 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  22.44 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  26.54 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  22.29 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  22.29 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  22.29 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 		 500 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  22.77 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  22.46 
 
 		 463 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  21.59 
 
 		 456 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4918  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.514357  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  21.59 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  20.88 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  23.26 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  29 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  21.97 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  21.88 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  20.88 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  23.34 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  23.91 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  22.04 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  23 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  23 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  23 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  23 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  23 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  23 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  20.54 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 		 482 aa  57  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  23.83 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  31.13 
 
 		 421 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  22.31 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>