More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3953 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 485 aa  957    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  46.19 
 
 		 485 aa  346  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  48.2 
 
 		 483 aa  344  2.9999999999999997e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  46.25 
 
 		 498 aa  340  5e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  47.22 
 
 		 486 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  42.25 
 
 		 495 aa  325  9e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  42.3 
 
 		 493 aa  320  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  40.42 
 
 		 479 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  40.42 
 
 		 479 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  38.63 
 
 		 484 aa  306  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  38.91 
 
 		 483 aa  306  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  37.55 
 
 		 467 aa  296  8e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  40.13 
 
 		 484 aa  292  8e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  41.18 
 
 		 497 aa  278  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  37.11 
 
 		 485 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  41.45 
 
 		 497 aa  272  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  38.18 
 
 		 509 aa  270  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  37.42 
 
 		 509 aa  269  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  36.15 
 
 		 487 aa  269  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  39.38 
 
 		 488 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  36.56 
 
 		 510 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  36.84 
 
 		 464 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  36.64 
 
 		 486 aa  259  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  39.95 
 
 		 492 aa  259  7e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  35.76 
 
 		 516 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  33.88 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  37.34 
 
 		 491 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  35.27 
 
 		 490 aa  246  8e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  35.9 
 
 		 496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  33.95 
 
 		 485 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  32.18 
 
 		 516 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  31.85 
 
 		 481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  29.66 
 
 		 510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  29.66 
 
 		 510 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  29.66 
 
 		 510 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  31.5 
 
 		 510 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  29.91 
 
 		 513 aa  205  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 		 502 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  32.75 
 
 		 527 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  32.08 
 
 		 504 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  28.39 
 
 		 474 aa  186  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  31.33 
 
 		 507 aa  156  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  29.15 
 
 		 469 aa  107  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  28.53 
 
 		 501 aa  103  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 		 497 aa  103  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 502 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 475 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 		 506 aa  99  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 		 507 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  26.59 
 
 		 468 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 		 459 aa  97.1  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 		 461 aa  95.9  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 477 aa  95.5  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  24.47 
 
 		 491 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 455 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 495 aa  87  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  26.23 
 
 		 449 aa  87  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  28.75 
 
 		 482 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 521 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  25.95 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  26.89 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.36 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 486 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  28.69 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  22.7 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  23.27 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  23.5 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  23.48 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  22.35 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  23.24 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  24.51 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  23.19 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  27.39 
 
 		 506 aa  74.3  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  23.53 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4908  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  24.65 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 516 aa  72.4  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  23.85 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  23 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  23.47 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>