294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1046 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 492 aa  968    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  54.66 
 
 		 486 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  42.06 
 
 		 485 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  48.71 
 
 		 498 aa  295  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  37.89 
 
 		 484 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  36.44 
 
 		 479 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  36.44 
 
 		 479 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  39.87 
 
 		 485 aa  259  7e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  38.91 
 
 		 497 aa  256  6e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  38.39 
 
 		 495 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  36.31 
 
 		 483 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  34.28 
 
 		 467 aa  247  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  35.15 
 
 		 464 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  34.69 
 
 		 485 aa  242  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  35.79 
 
 		 484 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  36.11 
 
 		 487 aa  240  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  37.86 
 
 		 509 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  41.71 
 
 		 483 aa  237  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  36.06 
 
 		 509 aa  231  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  38.33 
 
 		 488 aa  229  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  35.1 
 
 		 493 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  34.67 
 
 		 510 aa  226  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  33.94 
 
 		 486 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  36.06 
 
 		 497 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  35.78 
 
 		 516 aa  226  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 		 516 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  32.95 
 
 		 504 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  36.33 
 
 		 491 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  35.7 
 
 		 490 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  35.81 
 
 		 496 aa  203  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  30.19 
 
 		 510 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  30.19 
 
 		 510 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  30.19 
 
 		 510 aa  203  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  30.26 
 
 		 513 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 		 510 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  30.37 
 
 		 474 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  29.8 
 
 		 481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  30.07 
 
 		 485 aa  183  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  31.36 
 
 		 527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  31.94 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  31.95 
 
 		 504 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  32.31 
 
 		 507 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 475 aa  82  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 469 aa  79.7  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  23.58 
 
 		 461 aa  76.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 507 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 506 aa  72.8  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  28.71 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 511 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  23.01 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  27.46 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  25.88 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  21.96 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  24.7 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  23.5 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  21.24 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  22.75 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  24.86 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  20.33 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  23.3 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  24.73 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  20.77 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  23 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  24.47 
 
 		 526 aa  59.7  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  25.42 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  23.95 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  19.88 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  19.88 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  19.88 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  24.79 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  21.75 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  24.87 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  23.02 
 
 		 460 aa  57  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  25.48 
 
 		 458 aa  57  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 		 521 aa  56.6  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  25.42 
 
 		 458 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  21.17 
 
 		 450 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  28.89 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 527 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>