More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1629 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 485 aa  957    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  40.32 
 
 		 458 aa  296  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  36.22 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  36.22 
 
 		 456 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  36.34 
 
 		 456 aa  269  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  37.5 
 
 		 455 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  29.47 
 
 		 516 aa  180  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  31.62 
 
 		 506 aa  180  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1744  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 510 aa  177  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.579439  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  30.19 
 
 		 513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 		 497 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 516 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4678  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 		 508 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 517 aa  167  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5345  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5206  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 535 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959368  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5297  amino acid ABC transporter permease  26.62 
 
 		 535 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.00229664  normal  0.376722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0176  amino acid permease-associated region  27.94 
 
 		 512 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1574  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 		 503 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 511 aa  150  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4853  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 476 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0951  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 494 aa  144  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0877  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 517 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  27.27 
 
 		 553 aa  141  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 507 aa  140  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0758  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4908  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0719  amino acid permease family protein  24.57 
 
 		 469 aa  94  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.544014  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0867  amino acid permease-associated region  24.57 
 
 		 469 aa  94  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0935  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 513 aa  91.7  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 		 454 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 475 aa  86.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1492  amino acid transporter  27.76 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.0000000000000168224 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1792  amino acid transporter  27.16 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000593149  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1963  amino acid transporter  27.76 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.041678  hitchhiker  0.00000000765672 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1476  amino acid transporter  26.87 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.161402 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1181  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  26.87 
 
 		 447 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  0.0000000124915 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  26.12 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  25.95 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  27.24 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.63 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.63 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  23.44 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.63 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  25.65 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  26.89 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  23.52 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.36 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  26.2 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  25.94 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  24.74 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  24.58 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  25.17 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 526 aa  67.8  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.36 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  25.35 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  25.35 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  25.09 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  25.35 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  25.35 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  25.35 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  25.35 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 492 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  28.03 
 
 		 460 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 492 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 492 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  21.62 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.36 
 
 		 467 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4320  amino acid transporter  26.8 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.619853  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.36 
 
 		 467 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  24.79 
 
 		 461 aa  66.6  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  22.69 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  25.47 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  22.69 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  22.48 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  22.69 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  24.3 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  24.23 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>