More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0176 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5297  amino acid ABC transporter permease  92.79 
 
 		 535 aa  951    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.00229664  normal  0.376722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5345  amino acid permease-associated region  92.79 
 
 		 513 aa  951    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0176  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 512 aa  1023    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5206  amino acid permease-associated region  92.79 
 
 		 535 aa  951    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959368  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  60.68 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  57.67 
 
 		 553 aa  555  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0877  amino acid permease-associated region  59.2 
 
 		 517 aa  551  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1744  amino acid permease-associated region  55.25 
 
 		 510 aa  531  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.579439  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  60.24 
 
 		 507 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0758  amino acid permease-associated region  58.11 
 
 		 524 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  52.05 
 
 		 517 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  49.9 
 
 		 516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  41.85 
 
 		 516 aa  362  6e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1574  amino acid permease-associated region  42.92 
 
 		 503 aa  350  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4853  amino acid permease-associated region  40.21 
 
 		 476 aa  342  9e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0951  amino acid permease-associated region  40.9 
 
 		 494 aa  337  3.9999999999999995e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  40.66 
 
 		 506 aa  333  5e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  40.65 
 
 		 497 aa  332  9e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  36.78 
 
 		 513 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4678  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 508 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4908  amino acid permease-associated region  34.25 
 
 		 484 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  29.39 
 
 		 456 aa  171  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  28.07 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  27.86 
 
 		 456 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 485 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  27.92 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  24.9 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  25.31 
 
 		 465 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 462 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  24.3 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  21.65 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  24.25 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 764 aa  70.5  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 		 473 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  23.73 
 
 		 542 aa  69.7  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  25.38 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  26.65 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  26.65 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 549 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  23.79 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  23.01 
 
 		 455 aa  67  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  22.74 
 
 		 449 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 		 453 aa  66.6  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  22.72 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  22 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  22.6 
 
 		 538 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  22.27 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  22.72 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  22.69 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  23.59 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  23.49 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 506 aa  63.5  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  23.32 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  22.72 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  22.25 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 		 477 aa  62  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  23.32 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  22.17 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  23.18 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  22.65 
 
 		 443 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  23.44 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  23.3 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  23.88 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  23.44 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  23.44 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  23.44 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  23.44 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  23.44 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  22.95 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  23.5 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  23.44 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  23.15 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  22.08 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  23.99 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  24.87 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  22.29 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  23.15 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0973  amino acid permease-associated region  21.6 
 
 		 651 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  25.31 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  22.82 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>