More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0951 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4853  amino acid permease-associated region  68.44 
 
 		 476 aa  639    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  71.85 
 
 		 516 aa  674    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0951  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 494 aa  964    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1574  amino acid permease-associated region  66.67 
 
 		 503 aa  627  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  49.56 
 
 		 506 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  48.8 
 
 		 497 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1744  amino acid permease-associated region  47.65 
 
 		 510 aa  395  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.579439  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  44.27 
 
 		 553 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  45.6 
 
 		 516 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0877  amino acid permease-associated region  45.24 
 
 		 517 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  44.17 
 
 		 517 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5345  amino acid permease-associated region  42.33 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5297  amino acid ABC transporter permease  42.54 
 
 		 535 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.00229664  normal  0.376722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5206  amino acid permease-associated region  42.33 
 
 		 535 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959368  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0758  amino acid permease-associated region  46.11 
 
 		 524 aa  360  5e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  44.06 
 
 		 507 aa  356  5.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0176  amino acid permease-associated region  41.34 
 
 		 512 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  43.86 
 
 		 511 aa  336  5.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  39.63 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4678  amino acid permease-associated region  38.99 
 
 		 508 aa  307  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4908  amino acid permease-associated region  40.46 
 
 		 484 aa  286  7e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 485 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 456 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  27.23 
 
 		 458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  26.43 
 
 		 456 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  26.19 
 
 		 456 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 459 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 450 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 461 aa  99  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 461 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  24.89 
 
 		 461 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  24.89 
 
 		 461 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  24.89 
 
 		 461 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  24.89 
 
 		 461 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  24.89 
 
 		 461 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  24.94 
 
 		 461 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 443 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 456 aa  94  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 450 aa  94  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 450 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  24.41 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  24.71 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 443 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  25.94 
 
 		 443 aa  90.5  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 443 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 443 aa  89  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 443 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 443 aa  87.8  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 454 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  23.27 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  23.22 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  24.38 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2517  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0624875  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  24.72 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  24.7 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3082  amino acid permease  24.94 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  23.71 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2421  amino acid permease family protein  24.94 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 		 462 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  26.26 
 
 		 463 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  23.04 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  22.92 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  23.63 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  25.62 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 501 aa  73.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  23.13 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  29.45 
 
 		 538 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  24.85 
 
 		 449 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  24.48 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  24.48 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  24.48 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  24.48 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  24.48 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  24.48 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  24.48 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 770 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  25.5 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>