More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2678 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2649  amino acid permease-associated region  99.76 
 
 		 450 aa  823    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2678  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 420 aa  823    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0723531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2694  amino acid permease-associated region  99.76 
 
 		 450 aa  823    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0425419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1735  amino acid permease-associated region  67.33 
 
 		 452 aa  501  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51734  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  47.62 
 
 		 441 aa  361  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  47.39 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1908  amino acid permease-associated region  46.04 
 
 		 440 aa  341  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00117224  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3942  amino acid permease-associated region  48.85 
 
 		 445 aa  326  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3604  amino acid permease-associated region  48.85 
 
 		 445 aa  326  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0129  amino acid permease-associated region  43.17 
 
 		 451 aa  318  9e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0181  amino acid permease-associated region  44.66 
 
 		 443 aa  308  9e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2108  amino acid permease-associated region  42.43 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  29.1 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0278  amino acid permease-associated region  30.22 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0529  amino acid permease family protein  27.74 
 
 		 430 aa  121  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00437  predicted transporter  27.74 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0579  amino acid permease family protein  27.74 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00442  hypothetical protein  27.74 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0525  amino acid permease family protein  28.95 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3124  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3130  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  hitchhiker  0.000108674 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1136  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0565  amino acid permease family protein  28.95 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1315  amino acid permease-associated region  28.53 
 
 		 441 aa  116  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.172576  normal  0.0920117 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0421  amino acid permease family protein  28.57 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0070  amino acid transporter  31.84 
 
 		 279 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.462473  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0803  amino acid transporter  27.24 
 
 		 429 aa  97.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1272  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 431 aa  90.1  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 520 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  26.92 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 770 aa  80.5  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1066  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  23.8 
 
 		 489 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  24.28 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  22.6 
 
 		 515 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  23.65 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  24.57 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 786 aa  73.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 452 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 		 745 aa  72.8  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  27.44 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  23.26 
 
 		 471 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 471 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  29.03 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  23.23 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  24.2 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  24.2 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  24.2 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  24.2 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  24.2 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  24.2 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  23.97 
 
 		 471 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  23 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  23 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  23 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  24.56 
 
 		 500 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  23.49 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  24.8 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  28.32 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0681  amino acid permease-associated region  29.15 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 449 aa  67  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  25.38 
 
 		 441 aa  67  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0076  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 		 464 aa  67  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  25.19 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 485 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  22.58 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  22.77 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  22.77 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  22.77 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  22.35 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  24.77 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  28.49 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  22.35 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  21.34 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  22.26 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0156  amino acid permease-associated region  25.4 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.041937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  21.88 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  24.04 
 
 		 491 aa  63.5  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  24.23 
 
 		 483 aa  63.2  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  22.25 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  23.33 
 
 		 483 aa  63.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  22.2 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0241  amino acid permease  22.39 
 
 		 543 aa  62.8  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  23.26 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>