More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1457 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1457  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 446 aa  869    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1066  amino acid permease-associated region  32.36 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 786 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0278  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 		 434 aa  103  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 770 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  25.64 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 		 434 aa  90.5  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2108  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 445 aa  89.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1315  amino acid permease-associated region  30.39 
 
 		 441 aa  89  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.172576  normal  0.0920117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0129  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1908  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 440 aa  87  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00117224  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3942  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3604  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466276 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0529  amino acid permease family protein  22.47 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00437  predicted transporter  22.91 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00442  hypothetical protein  22.91 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0579  amino acid permease family protein  22.91 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3124  amino acid permease-associated region  23.22 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0565  amino acid permease family protein  23.22 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3130  amino acid permease-associated region  23.22 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  hitchhiker  0.000108674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0525  amino acid permease family protein  23.22 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  25.49 
 
 		 764 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0421  amino acid permease family protein  22.99 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  25.3 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0181  amino acid permease-associated region  23.82 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 716 aa  77  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  23.04 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1136  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  24.5 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  26.82 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  23.15 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  23.42 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  23.42 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  23.42 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  26.59 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 		 476 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 745 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 455 aa  69.7  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  26.98 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  26.01 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  24.15 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  21.93 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  22.94 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  23.65 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  23.87 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  24.27 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  24.04 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  22.77 
 
 		 471 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  25.27 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27.09 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  22.9 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  27.09 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  23.37 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  27.09 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  27.09 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 740 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  27.09 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  22.78 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  24.05 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  24.89 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  24.89 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  25.16 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  26.69 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.69 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  29.2 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 792 aa  63.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  22.77 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  24.95 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 725 aa  63.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  22.45 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  22.39 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  22.39 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.69 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.69 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  22.52 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  23.67 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  22.73 
 
 		 753 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0803  amino acid transporter  23.79 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  23.76 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  26.91 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  26.91 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  26.91 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  26.91 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  23.09 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  26.91 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  26.91 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  26.91 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  22.06 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  26.89 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>