220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_69488 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_69488  high affinity methionine permease  100 
 
 		 551 aa  1101    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.649926  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01631  methionine transporter (Eurofung)  56.56 
 
 		 540 aa  583  1.0000000000000001e-165  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.281549  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09490  methionine transporter (Eurofung)  38.38 
 
 		 510 aa  314  2.9999999999999996e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.769842 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02560  methionine transporter, putative (Eurofung)  33.8 
 
 		 560 aa  288  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.503958 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00310  high-affinity methionine permease, putative  35.39 
 
 		 582 aa  286  8e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07243  methionine transporter, putative (Eurofung)  39.77 
 
 		 557 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.366956  normal  0.430438 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45036  high affinity methionine permease  34.77 
 
 		 522 aa  274  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.245416  normal  0.788743 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10319  amino acid transporter (Eurofung)  33.89 
 
 		 514 aa  259  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_11329  methionine permease  34.13 
 
 		 459 aa  246  4.9999999999999997e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.408127 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28954  very low affinity methionine permease  28.73 
 
 		 550 aa  222  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144807  normal  0.597745 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09300  amino acid transporter (Eurofung)  23.92 
 
 		 614 aa  133  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.917977  normal  0.922161 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  28.62 
 
 		 609 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  25.44 
 
 		 580 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  26 
 
 		 443 aa  100  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 440 aa  93.2  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 440 aa  93.2  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 484 aa  88.6  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 482 aa  88.2  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  25.57 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  25.28 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  25.28 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  25.28 
 
 		 438 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 435 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  25.28 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  25.28 
 
 		 437 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  25.28 
 
 		 438 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  25.28 
 
 		 437 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  25.65 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09379  amino acid transporter, partial (Eurofung)  27.52 
 
 		 184 aa  80.1  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0862011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  24.18 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  24.85 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 499 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  23.35 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  23.15 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  22.01 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  22.35 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  25.15 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  25.97 
 
 		 473 aa  67  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  21.11 
 
 		 457 aa  67  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  22.02 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  25.07 
 
 		 470 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  25.07 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  22.86 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 529 aa  63.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  21.45 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  24.66 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  19.95 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  21.91 
 
 		 522 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  23.42 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  25.08 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  25.47 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  24.77 
 
 		 443 aa  57  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00206  lysine/cadaverine antiporter  22.94 
 
 		 448 aa  57  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  22.22 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002188  lysine/cadaverine antiporter membrane protein CadB  23.24 
 
 		 447 aa  56.2  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000189693  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2657  lysine/cadaverine antiporter  22.25 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  23.62 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 543 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  23.62 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  23.62 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  23.62 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 		 616 aa  54.7  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  22.14 
 
 		 472 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  21.84 
 
 		 664 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 530 aa  54.3  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  24.54 
 
 		 441 aa  54.3  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 447 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  21.84 
 
 		 642 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  21.84 
 
 		 642 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 786 aa  53.9  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  22.9 
 
 		 444 aa  53.9  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  21.84 
 
 		 666 aa  53.9  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08538  amino acid transporter (Eurofung)  23.25 
 
 		 507 aa  53.5  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2934  lysine/cadaverine antiporter  23.78 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.252343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  21.94 
 
 		 445 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  24.86 
 
 		 422 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2800  lysine/cadaverine antiporter  23.78 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.1623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  21.94 
 
 		 445 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 		 537 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  21.94 
 
 		 445 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2821  lysine/cadaverine antiporter  23.78 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  21.94 
 
 		 445 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  22.22 
 
 		 541 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2717  lysine/cadaverine antiporter  23.78 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2759  lysine/cadaverine antiporter  23.78 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  22.1 
 
 		 439 aa  52.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  22.22 
 
 		 519 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  24.4 
 
 		 469 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  22.49 
 
 		 463 aa  52.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 469 aa  52.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>