More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1103 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  71.62 
 
 		 732 aa  992    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  63.6 
 
 		 727 aa  890    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  61.57 
 
 		 716 aa  834    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 716 aa  1430    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  46.67 
 
 		 721 aa  642    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  73.99 
 
 		 751 aa  1081    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  46.85 
 
 		 706 aa  591  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  46.31 
 
 		 708 aa  585  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  40.38 
 
 		 719 aa  549  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  39.58 
 
 		 715 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  36.46 
 
 		 709 aa  397  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  36.08 
 
 		 688 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  34.3 
 
 		 689 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  37.92 
 
 		 679 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  33.53 
 
 		 686 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  38.28 
 
 		 681 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0038  sodium/hydrogen exchanger  33.92 
 
 		 692 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  30.58 
 
 		 712 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  29.78 
 
 		 698 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  29.46 
 
 		 698 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  29.58 
 
 		 692 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 		 722 aa  226  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1642  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  30.47 
 
 		 699 aa  190  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1401  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  30.1 
 
 		 699 aa  184  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.972731  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0307  Na+/H+ antiporter  35 
 
 		 408 aa  174  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  30.56 
 
 		 386 aa  118  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25 
 
 		 609 aa  103  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.41 
 
 		 609 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.64 
 
 		 609 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  25.17 
 
 		 609 aa  102  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.53 
 
 		 609 aa  102  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  24.53 
 
 		 609 aa  102  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  24.53 
 
 		 609 aa  102  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.53 
 
 		 609 aa  102  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.53 
 
 		 609 aa  102  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  26.17 
 
 		 395 aa  100  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  28.01 
 
 		 530 aa  100  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.29 
 
 		 609 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 		 609 aa  96.3  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  25.27 
 
 		 390 aa  90.1  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 		 614 aa  89.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 		 614 aa  89.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  29.04 
 
 		 611 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  25.37 
 
 		 614 aa  85.9  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  32.21 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  26.99 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  29.03 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  25.39 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  25.39 
 
 		 389 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  23.65 
 
 		 756 aa  83.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  24.43 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  25.37 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  22.99 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  27.74 
 
 		 388 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  27.24 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.64 
 
 		 608 aa  79  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1282  sodium/hydrogen exchanger  24.5 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  26.18 
 
 		 423 aa  76.6  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  23.68 
 
 		 387 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  23.94 
 
 		 387 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25.37 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  23.94 
 
 		 387 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  24.24 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  23.58 
 
 		 352 aa  76.6  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  24.24 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  23.94 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  23.94 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  23.94 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  23.95 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  24.76 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  24.55 
 
 		 609 aa  73.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.23 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  23.42 
 
 		 387 aa  72  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  25.72 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  24.11 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  22.95 
 
 		 482 aa  70.5  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  28.52 
 
 		 388 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  27.53 
 
 		 757 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.75 
 
 		 407 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.37 
 
 		 407 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.35 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  24.22 
 
 		 566 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  24.92 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  29 
 
 		 662 aa  69.7  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.12 
 
 		 579 aa  68.9  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  20.73 
 
 		 764 aa  68.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  25.97 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.35 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  26.05 
 
 		 666 aa  67.8  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.35 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  25.16 
 
 		 656 aa  67.8  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  26.36 
 
 		 567 aa  67.8  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  30.95 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  27.12 
 
 		 636 aa  67.8  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  23.49 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  31.5 
 
 		 407 aa  67.4  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  26.91 
 
 		 484 aa  67  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000729524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>