More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0764 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
395 aa  759    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  66.75 
 
 
399 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  59.61 
 
 
423 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  65.06 
 
 
404 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  34.88 
 
 
445 aa  209  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  34.04 
 
 
387 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  34.3 
 
 
387 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  34.04 
 
 
387 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  34.04 
 
 
387 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  33.51 
 
 
385 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  34.04 
 
 
387 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  34.04 
 
 
387 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  34.04 
 
 
387 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  33.77 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  33.51 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  33.25 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  32.45 
 
 
375 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  32.45 
 
 
375 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  32.45 
 
 
375 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  32.45 
 
 
375 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  32.45 
 
 
375 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  32.45 
 
 
375 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  34.38 
 
 
382 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  34.96 
 
 
396 aa  187  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  31.91 
 
 
375 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  33.07 
 
 
375 aa  186  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  36.81 
 
 
389 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  32.18 
 
 
375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  32.18 
 
 
375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  32.18 
 
 
375 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  35.16 
 
 
399 aa  180  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  38.16 
 
 
385 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  32.62 
 
 
398 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  35.43 
 
 
400 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  35.48 
 
 
416 aa  159  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  35.06 
 
 
399 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  31.19 
 
 
412 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  30.32 
 
 
386 aa  157  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  32.13 
 
 
424 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  32.53 
 
 
424 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  31.33 
 
 
379 aa  155  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  30.98 
 
 
375 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  31.07 
 
 
412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  33.82 
 
 
491 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.29 
 
 
427 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.81 
 
 
418 aa  150  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  36.06 
 
 
413 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  36.5 
 
 
413 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  32.64 
 
 
402 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  35.13 
 
 
474 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  35.38 
 
 
415 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 
467 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 
467 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 
389 aa  142  9e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  29.61 
 
 
352 aa  142  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  33.8 
 
 
473 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  33.9 
 
 
469 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 
404 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  33.43 
 
 
479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  33.62 
 
 
453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  28.24 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  33.82 
 
 
485 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  32.46 
 
 
479 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  28.85 
 
 
586 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  28.85 
 
 
586 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 
586 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  28.3 
 
 
586 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.79 
 
 
587 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0454  Na+/H+ antiporter  27.74 
 
 
701 aa  124  4e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  28.02 
 
 
585 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  28.3 
 
 
587 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  27.75 
 
 
585 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  26.07 
 
 
636 aa  119  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1412  sodium/hydrogen exchanger  28.03 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  26.54 
 
 
586 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.75 
 
 
587 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1282  sodium/hydrogen exchanger  26.34 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  29.54 
 
 
390 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  29.2 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  28.07 
 
 
782 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  26.41 
 
 
423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 
585 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 
586 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  34.93 
 
 
425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  26.49 
 
 
741 aa  112  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 
513 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  30.86 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  31.2 
 
 
386 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  27.66 
 
 
585 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  28.65 
 
 
584 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  27.51 
 
 
756 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  26.48 
 
 
387 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  28.93 
 
 
414 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 
585 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.64 
 
 
430 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  31.56 
 
 
767 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  27.13 
 
 
585 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>