More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1799 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
462 aa  876    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  80.57 
 
 
467 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  80.57 
 
 
467 aa  666    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  67.87 
 
 
473 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  72.28 
 
 
491 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  66.2 
 
 
469 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  67.93 
 
 
513 aa  528  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  63.39 
 
 
453 aa  528  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  60.09 
 
 
474 aa  528  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  65.21 
 
 
460 aa  486  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  65.42 
 
 
485 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  44.04 
 
 
457 aa  326  6e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  42.53 
 
 
457 aa  316  5e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  42.53 
 
 
457 aa  316  5e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18091  CPA2 family Na+/H+ antiporter  43.32 
 
 
455 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17921  CPA2 family Na+/H+ antiporter  43.22 
 
 
455 aa  312  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0153  CPA2 family Na+/H+ antiporter  45.73 
 
 
458 aa  311  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.430918  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1692  CPA2 family Na+/H+ antiporter  43.22 
 
 
455 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0183  CPA2 family Na+/H+ antiporter  45.39 
 
 
458 aa  310  5e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17871  CPA2 family Na+/H+ antiporter  43.09 
 
 
455 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  42.52 
 
 
457 aa  305  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  39.56 
 
 
413 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  39.32 
 
 
413 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
404 aa  216  5e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  39.17 
 
 
415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  33.69 
 
 
479 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  32.63 
 
 
479 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  33.95 
 
 
424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.26 
 
 
427 aa  197  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  33.72 
 
 
424 aa  193  4e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  33.09 
 
 
375 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  33.09 
 
 
375 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  33.33 
 
 
375 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  33.09 
 
 
375 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  33.09 
 
 
375 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  32.85 
 
 
375 aa  187  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  31.07 
 
 
385 aa  186  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  32.61 
 
 
375 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  35.35 
 
 
385 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  30.37 
 
 
387 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  32.2 
 
 
375 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  30.82 
 
 
387 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  30.82 
 
 
387 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  31.06 
 
 
387 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  33.56 
 
 
398 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  31.19 
 
 
387 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  30.59 
 
 
387 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  31.57 
 
 
402 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  30.95 
 
 
387 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  30.95 
 
 
387 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  30.95 
 
 
387 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  30.59 
 
 
387 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  32.08 
 
 
397 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  33.09 
 
 
375 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  32.77 
 
 
389 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  32.85 
 
 
375 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  32.85 
 
 
375 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  30.41 
 
 
396 aa  169  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.51 
 
 
399 aa  167  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  32.54 
 
 
382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.3 
 
 
418 aa  158  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 
412 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
400 aa  156  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  32.2 
 
 
416 aa  155  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  34.25 
 
 
399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  27.82 
 
 
389 aa  151  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  29.59 
 
 
375 aa  150  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 
445 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 
392 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  28.15 
 
 
390 aa  145  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  30.54 
 
 
749 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  31.46 
 
 
392 aa  143  8e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  30.26 
 
 
750 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  29.98 
 
 
399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.72 
 
 
386 aa  141  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0454  Na+/H+ antiporter  27.13 
 
 
701 aa  139  1e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  29.31 
 
 
379 aa  139  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  29.81 
 
 
748 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 
392 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  33.24 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  30.37 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 
412 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  29.64 
 
 
423 aa  134  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  29.04 
 
 
388 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 
388 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 
756 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.11 
 
 
352 aa  126  7e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  29.64 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  29.88 
 
 
587 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  29.88 
 
 
585 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  29.88 
 
 
585 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  29.36 
 
 
460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  28.84 
 
 
423 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 
436 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.88 
 
 
587 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  28.26 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  28.26 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 
586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>