More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3217 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 397 aa  774    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  63.52 
 
 		 402 aa  491  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  39.49 
 
 		 404 aa  269  8e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  34.77 
 
 		 474 aa  193  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  33.42 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  34.56 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  34.56 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  34.56 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  34.56 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  34.56 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  34.18 
 
 		 469 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  34.23 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  34.15 
 
 		 387 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  34.23 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  33.91 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  34.07 
 
 		 387 aa  186  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  33.03 
 
 		 473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  33.01 
 
 		 467 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  33.01 
 
 		 467 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  32.14 
 
 		 386 aa  176  5e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  33.01 
 
 		 491 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  34.59 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  34 
 
 		 398 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  32.51 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  31.46 
 
 		 375 aa  163  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  31.46 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  31.46 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  31.46 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  31.46 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  31.46 
 
 		 375 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  31.46 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  30.69 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  32.02 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  32.78 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  33.05 
 
 		 479 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  31.31 
 
 		 424 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  31.46 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  31.46 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  31.46 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  33.52 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0183  CPA2 family Na+/H+ antiporter  30.23 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.62 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  34.4 
 
 		 462 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  32.71 
 
 		 457 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  30.99 
 
 		 424 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  31.86 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.86 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0153  CPA2 family Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 		 458 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.430918  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  35.31 
 
 		 415 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  30.52 
 
 		 423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  28.43 
 
 		 416 aa  146  8.000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 		 513 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  34.55 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  30.89 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  31.85 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  31.19 
 
 		 457 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  33.01 
 
 		 460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  33.68 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17871  CPA2 family Na+/H+ antiporter  32.4 
 
 		 455 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.61 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17921  CPA2 family Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1692  CPA2 family Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  27.92 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18091  CPA2 family Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 		 455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  29.88 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  34.01 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 		 748 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.55 
 
 		 418 aa  129  7.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  29.08 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  29.57 
 
 		 585 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  30.12 
 
 		 586 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  29.78 
 
 		 586 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  29.46 
 
 		 587 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  29.57 
 
 		 585 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  29.78 
 
 		 586 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  28.92 
 
 		 399 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  29.08 
 
 		 455 aa  122  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  28.67 
 
 		 392 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  29.28 
 
 		 586 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.25 
 
 		 587 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  31.68 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  29.25 
 
 		 749 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.96 
 
 		 587 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  28.61 
 
 		 421 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  29.38 
 
 		 392 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  29.7 
 
 		 750 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  28.25 
 
 		 741 aa  116  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  27.88 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  29.68 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.47 
 
 		 352 aa  113  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  29.24 
 
 		 747 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  29.87 
 
 		 582 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  30.86 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>