More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1633 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  832    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  59.61 
 
 		 395 aa  457  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  58.27 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  59.21 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  33.01 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  33.01 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  33.01 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  32.76 
 
 		 387 aa  209  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  32.52 
 
 		 387 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  32.52 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  32.52 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  32.27 
 
 		 387 aa  206  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  32.51 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  32.03 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  34.12 
 
 		 375 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  34.12 
 
 		 375 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  34.12 
 
 		 375 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  34.12 
 
 		 375 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  33.86 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  32.59 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  33.33 
 
 		 375 aa  200  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  34.29 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  33.6 
 
 		 375 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  33.65 
 
 		 445 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  33.86 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  33.07 
 
 		 375 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  33.07 
 
 		 375 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.09 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  34.26 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  37.46 
 
 		 385 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  33.75 
 
 		 389 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  32.33 
 
 		 396 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  35.32 
 
 		 400 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  33.05 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  37.34 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  30.81 
 
 		 386 aa  159  8e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  31.88 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  32.4 
 
 		 416 aa  154  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  31.6 
 
 		 389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  33.07 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.25 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  29.8 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  31.75 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  30.66 
 
 		 467 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  30.66 
 
 		 467 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  30.45 
 
 		 397 aa  139  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.52 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  30.18 
 
 		 375 aa  137  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  32.42 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  31.11 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  29.45 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  31.34 
 
 		 424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  32.07 
 
 		 473 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  32.19 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  25.97 
 
 		 412 aa  129  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  30.48 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  30.87 
 
 		 474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  30.18 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.2 
 
 		 587 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.2 
 
 		 587 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  29.36 
 
 		 667 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  29.73 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  26.51 
 
 		 586 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 		 425 aa  116  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  28.37 
 
 		 414 aa  116  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 		 586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  26.51 
 
 		 586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  26.77 
 
 		 586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  30.43 
 
 		 767 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0751  potassium efflux system protein  29.28 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  30.09 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  26.84 
 
 		 585 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0747  potassium efflux system protein  28.41 
 
 		 398 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  26.58 
 
 		 585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  27.58 
 
 		 567 aa  111  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  29.21 
 
 		 585 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  26.99 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  29.26 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  28.01 
 
 		 585 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.74 
 
 		 567 aa  107  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  30.4 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.25 
 
 		 585 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  31.64 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 		 567 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  26.89 
 
 		 756 aa  106  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0543  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 		 631 aa  106  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.015433 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  30.98 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  26.93 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  25.88 
 
 		 586 aa  104  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  30.63 
 
 		 457 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  24.44 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  25.54 
 
 		 636 aa  103  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  28.86 
 
 		 684 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  31.04 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>