More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0433 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 387 aa  736    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  33.76 
 
 		 414 aa  185  9e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  32.02 
 
 		 386 aa  166  8e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  31.36 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  28.92 
 
 		 375 aa  149  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  30.05 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  29.26 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  29.89 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  29.89 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  29.89 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  29.89 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  29.26 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  29.89 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  28.91 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  30.13 
 
 		 389 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  28.01 
 
 		 445 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  29.13 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  29.89 
 
 		 375 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  29.89 
 
 		 375 aa  133  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  29.89 
 
 		 375 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  28.27 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  27.63 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  28.8 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  28.8 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  27.37 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  28.8 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.75 
 
 		 399 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  27.49 
 
 		 387 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  27.49 
 
 		 387 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  28.53 
 
 		 387 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  27.75 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.98 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 		 385 aa  127  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.26 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  29.44 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  26.44 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  28.03 
 
 		 587 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  28.16 
 
 		 382 aa  119  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  25.73 
 
 		 491 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  27.11 
 
 		 585 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  27.3 
 
 		 585 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  27.49 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 		 586 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  26.36 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  27.96 
 
 		 586 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.55 
 
 		 427 aa  116  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.61 
 
 		 587 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  26.48 
 
 		 395 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 		 586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  29.41 
 
 		 715 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 		 474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 		 586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  26.84 
 
 		 424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.69 
 
 		 587 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  27.2 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 		 435 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  29.7 
 
 		 748 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  26.84 
 
 		 424 aa  113  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  30.63 
 
 		 415 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 		 756 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  24.44 
 
 		 423 aa  112  9e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  26.08 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 		 416 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  27.25 
 
 		 764 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1282  sodium/hydrogen exchanger  26.58 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  28.35 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  28.15 
 
 		 650 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  27.75 
 
 		 404 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  26.03 
 
 		 389 aa  109  9.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  29.22 
 
 		 614 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 		 567 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.02 
 
 		 567 aa  107  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  27.74 
 
 		 750 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  26.53 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 		 446 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 		 567 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  25.12 
 
 		 414 aa  106  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 		 453 aa  106  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 		 585 aa  106  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  26.88 
 
 		 585 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  26.88 
 
 		 585 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  26.63 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 		 467 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 		 467 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  29.66 
 
 		 609 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 		 609 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  24.65 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.22 
 
 		 609 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  28.22 
 
 		 609 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  28.22 
 
 		 609 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  28.22 
 
 		 609 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.22 
 
 		 609 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>