More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0499 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  100 
 
 		 389 aa  754    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  52.96 
 
 		 390 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  28.53 
 
 		 385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  28.61 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  28.08 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  28.08 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  28.08 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  28.08 
 
 		 387 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  28.08 
 
 		 387 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  27.82 
 
 		 387 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  27.82 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  27.82 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  28.08 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  31.22 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  30.95 
 
 		 445 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  27.08 
 
 		 375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  27.35 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  29.73 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  26.81 
 
 		 375 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.81 
 
 		 375 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  26.81 
 
 		 375 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  26.81 
 
 		 375 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  26.81 
 
 		 375 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  27.35 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.66 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  29.65 
 
 		 414 aa  139  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  26.54 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  26.54 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.54 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  28.24 
 
 		 412 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  28.91 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  29.59 
 
 		 375 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  25.53 
 
 		 400 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 482 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  28.16 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  29.43 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  26.75 
 
 		 389 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  29.5 
 
 		 756 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.32 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  28.68 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  28.24 
 
 		 396 aa  119  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 		 392 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  26.35 
 
 		 748 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  26.13 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  28.66 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 473 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  28.17 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  28.57 
 
 		 399 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  26.01 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  27.49 
 
 		 474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  26.93 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  30.23 
 
 		 479 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  26.82 
 
 		 764 aa  110  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.45 
 
 		 352 aa  110  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  25.43 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  25.43 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  27.55 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  27.69 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  27.98 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  27.76 
 
 		 767 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 		 749 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 		 388 aa  106  9e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 750 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  28.06 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  25.77 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.16 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  27.45 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  29.38 
 
 		 479 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  27.66 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 		 586 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 		 586 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 		 586 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  28.02 
 
 		 485 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  26.43 
 
 		 513 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  27.62 
 
 		 586 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 		 462 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  27.75 
 
 		 585 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  27.35 
 
 		 587 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  25.63 
 
 		 436 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  27.67 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  26.57 
 
 		 715 aa  98.6  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  27.75 
 
 		 585 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  24.88 
 
 		 469 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  26.17 
 
 		 747 aa  97.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1282  sodium/hydrogen exchanger  25.54 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  24.01 
 
 		 410 aa  96.3  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.96 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.65 
 
 		 587 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  25.31 
 
 		 775 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  23.75 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>