More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0325 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
398 aa  764    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  32.57 
 
 
392 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  32.56 
 
 
392 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  32.32 
 
 
392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  34.01 
 
 
382 aa  169  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  32.3 
 
 
388 aa  168  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  31.54 
 
 
375 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  31.62 
 
 
388 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 
445 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  31.79 
 
 
388 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  32.41 
 
 
375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  32.41 
 
 
375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  32.66 
 
 
375 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  32.66 
 
 
375 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  32.66 
 
 
375 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  32.66 
 
 
375 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  32.66 
 
 
375 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  30.56 
 
 
387 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  30.63 
 
 
387 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  30.89 
 
 
387 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  30.56 
 
 
387 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  30.56 
 
 
387 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  30.3 
 
 
387 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  30.3 
 
 
387 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  30.3 
 
 
387 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  30.3 
 
 
387 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  30.05 
 
 
387 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  32.41 
 
 
375 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  32.41 
 
 
375 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  32.41 
 
 
375 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  29.82 
 
 
385 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  30.52 
 
 
389 aa  149  9e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  30.89 
 
 
389 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  31.03 
 
 
386 aa  145  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.35 
 
 
399 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  31.09 
 
 
400 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.45 
 
 
418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  34.43 
 
 
399 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  30.42 
 
 
379 aa  137  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  31.74 
 
 
375 aa  134  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.7 
 
 
427 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  32.22 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 
412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  29.98 
 
 
424 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  30.27 
 
 
424 aa  129  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  26.72 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  29.36 
 
 
474 aa  116  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  28.33 
 
 
748 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  28.05 
 
 
473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  27.63 
 
 
404 aa  110  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 
467 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 
467 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 
413 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  27.34 
 
 
389 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  29.25 
 
 
385 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  27.23 
 
 
413 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  27.8 
 
 
469 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 
399 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 
390 aa  101  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  26.55 
 
 
423 aa  99.8  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  28.77 
 
 
485 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  27.82 
 
 
453 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  26.26 
 
 
750 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  28 
 
 
460 aa  98.6  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  27.1 
 
 
491 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 
397 aa  96.7  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  27.82 
 
 
749 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 
414 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  29.01 
 
 
387 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  24.36 
 
 
414 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.6 
 
 
587 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  24.77 
 
 
479 aa  93.6  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  26.98 
 
 
441 aa  93.6  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  24.43 
 
 
479 aa  92.8  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.6 
 
 
587 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  26.6 
 
 
587 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 
586 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  26.5 
 
 
585 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  26.5 
 
 
585 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  27.12 
 
 
586 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  26.4 
 
 
414 aa  90.1  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  27.23 
 
 
513 aa  89.7  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  26.58 
 
 
586 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A26  Kef-type K+ transport systems, membrane component  28.42 
 
 
320 aa  89.7  8e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  26.48 
 
 
457 aa  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  26.48 
 
 
457 aa  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  25.12 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  27.12 
 
 
457 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  26.11 
 
 
586 aa  89.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  26.03 
 
 
586 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  26.65 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  23.23 
 
 
756 aa  86.7  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  26.33 
 
 
741 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 
585 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>