More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2825 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  81.33 
 
 		 748 aa  1116    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 749 aa  1443    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  37.15 
 
 		 750 aa  357  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  38.92 
 
 		 436 aa  247  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  39.75 
 
 		 435 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  35.96 
 
 		 460 aa  236  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  39.02 
 
 		 446 aa  234  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 756 aa  204  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  31.23 
 
 		 715 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  31.23 
 
 		 715 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  30.6 
 
 		 747 aa  200  7e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  26.64 
 
 		 764 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  34.18 
 
 		 715 aa  198  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  34.14 
 
 		 573 aa  196  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  35.82 
 
 		 452 aa  191  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  33.98 
 
 		 389 aa  188  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  28.94 
 
 		 723 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  30.96 
 
 		 767 aa  182  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  31.14 
 
 		 421 aa  183  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  31.18 
 
 		 775 aa  183  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 		 448 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  29.82 
 
 		 448 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 		 423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  33.11 
 
 		 689 aa  174  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  29.3 
 
 		 816 aa  173  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 		 703 aa  168  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.46 
 
 		 430 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  29.28 
 
 		 387 aa  163  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  29.03 
 
 		 387 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  29.03 
 
 		 387 aa  162  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  29.03 
 
 		 387 aa  162  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  30.5 
 
 		 419 aa  161  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  29.03 
 
 		 387 aa  161  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  29.03 
 
 		 387 aa  161  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  28.54 
 
 		 387 aa  160  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  29.03 
 
 		 387 aa  160  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  29.03 
 
 		 387 aa  160  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  32.73 
 
 		 460 aa  160  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  28.78 
 
 		 387 aa  160  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 		 495 aa  159  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  27.67 
 
 		 455 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.32 
 
 		 442 aa  159  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  28 
 
 		 385 aa  157  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 482 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  31.54 
 
 		 420 aa  154  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  30.56 
 
 		 445 aa  154  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 414 aa  154  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  32.52 
 
 		 400 aa  154  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 		 422 aa  153  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 414 aa  153  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  30.7 
 
 		 883 aa  151  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  29.73 
 
 		 410 aa  151  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  28.23 
 
 		 951 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  34.87 
 
 		 413 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  32.63 
 
 		 469 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  36.12 
 
 		 413 aa  147  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  29.43 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  27.82 
 
 		 375 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  33.26 
 
 		 416 aa  145  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  32.53 
 
 		 473 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  26.68 
 
 		 414 aa  144  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 		 406 aa  144  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  32.06 
 
 		 457 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.12 
 
 		 410 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 		 406 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.12 
 
 		 410 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  27.41 
 
 		 375 aa  142  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 		 410 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  27.65 
 
 		 375 aa  142  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  26.87 
 
 		 375 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  26.87 
 
 		 375 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.87 
 
 		 375 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  26.87 
 
 		 375 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  26.87 
 
 		 375 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  33.89 
 
 		 415 aa  141  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 412 aa  140  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 		 385 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18091  CPA2 family Na+/H+ antiporter  30.88 
 
 		 455 aa  139  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 		 453 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17871  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.47 
 
 		 455 aa  139  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17921  CPA2 family Na+/H+ antiporter  30.88 
 
 		 455 aa  138  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  27.97 
 
 		 479 aa  137  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  30.3 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.06 
 
 		 457 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1692  CPA2 family Na+/H+ antiporter  30.89 
 
 		 455 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  30.3 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  27.44 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 		 474 aa  136  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0183  CPA2 family Na+/H+ antiporter  31.24 
 
 		 458 aa  135  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  32.3 
 
 		 683 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 		 467 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 		 467 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 		 429 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  31.69 
 
 		 425 aa  132  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  28.47 
 
 		 424 aa  132  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 		 424 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  26.87 
 
 		 375 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  26.87 
 
 		 375 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  30.2 
 
 		 382 aa  131  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.19 
 
 		 427 aa  130  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>