More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0928 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  100 
 
 		 430 aa  839    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  64.56 
 
 		 448 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  64.56 
 
 		 448 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  68.25 
 
 		 442 aa  489  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  44.47 
 
 		 423 aa  308  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  40.44 
 
 		 715 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  40.19 
 
 		 715 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  38.82 
 
 		 756 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  39.31 
 
 		 747 aa  246  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  38.82 
 
 		 764 aa  245  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  39.81 
 
 		 723 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  38.76 
 
 		 482 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  34.25 
 
 		 410 aa  237  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  39.9 
 
 		 775 aa  236  8e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  37.25 
 
 		 767 aa  235  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.75 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  38.89 
 
 		 715 aa  226  5.0000000000000005e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  34.5 
 
 		 410 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  35.24 
 
 		 495 aa  223  7e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.5 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  34.51 
 
 		 414 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  35.64 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  39.85 
 
 		 689 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  35.97 
 
 		 455 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  34.51 
 
 		 414 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  38.57 
 
 		 703 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  37.47 
 
 		 460 aa  206  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  33.58 
 
 		 406 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  36.04 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  37.57 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 406 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  34.19 
 
 		 951 aa  200  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  36.6 
 
 		 419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  36.39 
 
 		 416 aa  196  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  37.56 
 
 		 429 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  35.93 
 
 		 425 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.82 
 
 		 444 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  32.82 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.56 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  32.56 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  32.67 
 
 		 748 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  31.5 
 
 		 816 aa  179  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 750 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  32.36 
 
 		 749 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  32.72 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  31.54 
 
 		 444 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  36.57 
 
 		 683 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  34.8 
 
 		 427 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  31.81 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  35.73 
 
 		 883 aa  166  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  31.68 
 
 		 436 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  33.76 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  39.09 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  34.74 
 
 		 452 aa  156  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  32.9 
 
 		 439 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  35.16 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  31.07 
 
 		 573 aa  143  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  31.16 
 
 		 382 aa  140  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  28.86 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  29.11 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  29.37 
 
 		 385 aa  133  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  28.61 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  28.61 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  28.61 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  28.61 
 
 		 387 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  28.61 
 
 		 387 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  28.61 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  27.7 
 
 		 375 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3203  sodium/hydrogen exchanger  30.38 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  31.79 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.79 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.79 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.79 
 
 		 547 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.79 
 
 		 547 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  27.85 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  31.79 
 
 		 592 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  27.85 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 		 389 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  31.79 
 
 		 625 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  31.95 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.93 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 		 445 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  26.12 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  26.82 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  27.48 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  27.18 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3230  sodium/hydrogen exchanger  29.13 
 
 		 401 aa  119  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  27.92 
 
 		 414 aa  119  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  27.43 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  27.21 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  27.21 
 
 		 375 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.21 
 
 		 375 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  27.21 
 
 		 375 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  27.21 
 
 		 375 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  26.39 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  28.88 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.8 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  26.99 
 
 		 424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  28.88 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>