More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5898 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  100 
 
 
683 aa  1296    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  53.1 
 
 
689 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  50.37 
 
 
703 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  56.37 
 
 
416 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  52.52 
 
 
427 aa  340  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  37.33 
 
 
747 aa  325  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  38.31 
 
 
723 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  38.64 
 
 
715 aa  298  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  36.21 
 
 
756 aa  294  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  35.86 
 
 
715 aa  294  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  35.69 
 
 
715 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  43.92 
 
 
420 aa  276  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  45.52 
 
 
429 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  34.2 
 
 
764 aa  261  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  38.9 
 
 
767 aa  259  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  40.59 
 
 
482 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  37.42 
 
 
775 aa  253  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  38.98 
 
 
495 aa  247  6.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  41.71 
 
 
460 aa  243  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  37.07 
 
 
419 aa  238  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  35.97 
 
 
455 aa  231  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  38.78 
 
 
421 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  33.02 
 
 
951 aa  223  8e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  46.63 
 
 
416 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  36.52 
 
 
448 aa  219  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  36.52 
 
 
448 aa  219  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  35.78 
 
 
816 aa  214  4.9999999999999996e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  35.58 
 
 
423 aa  205  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  37.44 
 
 
425 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  37.47 
 
 
414 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  37.47 
 
 
414 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  39.31 
 
 
439 aa  187  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  34.86 
 
 
883 aa  183  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  37.69 
 
 
422 aa  183  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.14 
 
 
430 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.26 
 
 
442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  35.44 
 
 
750 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  34.8 
 
 
460 aa  165  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  35.47 
 
 
410 aa  162  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  34.81 
 
 
435 aa  161  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  34.71 
 
 
406 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  34.06 
 
 
406 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  33.97 
 
 
573 aa  156  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  35.68 
 
 
436 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  35.15 
 
 
413 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  32.71 
 
 
748 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.58 
 
 
444 aa  154  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.58 
 
 
444 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  33.58 
 
 
444 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  33.58 
 
 
444 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  34.37 
 
 
446 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  32.01 
 
 
749 aa  150  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.72 
 
 
410 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.24 
 
 
410 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  32.41 
 
 
444 aa  144  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  33.9 
 
 
410 aa  144  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  36.3 
 
 
452 aa  143  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  31.59 
 
 
412 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  36.25 
 
 
400 aa  138  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  35.21 
 
 
425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  27.09 
 
 
414 aa  134  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  27.27 
 
 
387 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  27.27 
 
 
387 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  26.82 
 
 
375 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  26.57 
 
 
375 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  26.57 
 
 
375 aa  128  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  27.27 
 
 
387 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  27.27 
 
 
387 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  26.57 
 
 
375 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.57 
 
 
375 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  26.57 
 
 
375 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  26.57 
 
 
375 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  26.55 
 
 
387 aa  127  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  27.27 
 
 
387 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  27.02 
 
 
387 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.79 
 
 
625 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  30.37 
 
 
389 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  27.02 
 
 
387 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  27.02 
 
 
387 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  27.02 
 
 
387 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  32.79 
 
 
592 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.79 
 
 
547 aa  127  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.79 
 
 
547 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  27.16 
 
 
385 aa  125  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  28.72 
 
 
445 aa  124  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  28.24 
 
 
382 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  26.07 
 
 
375 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3203  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 
404 aa  122  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 
424 aa  121  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.79 
 
 
410 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  32.79 
 
 
410 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.79 
 
 
410 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  26.57 
 
 
375 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  26.57 
 
 
375 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  22.44 
 
 
396 aa  117  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.57 
 
 
375 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  31.45 
 
 
435 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4191  Sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 
399 aa  111  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 
404 aa  111  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  36.66 
 
 
413 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>